>MA0485.2	HOXC9
A  [  4347      0      0   4250      5  15541  15541  15541  15541   3256 ]
C  [  1760    147  15541      0      5      0      0     12   2033   5037 ]
G  [ 15541      0      0  15541     11      0      0      0   1366   2191 ]
T  [     0  15541      0      0  15541   2094      0      0   3541   5057 ]
>MA0485.3	HOXC9
A  [  4347      0      0   4250      5  15541  15541  15541  15541 ]
C  [  1760    147  15541      0      5      0      0     12   2033 ]
G  [ 15541      0      0  15541     11      0      0      0   1366 ]
T  [     0  15541      0      0  15541   2094      0      0   3541 ]
>MA2677.1	HOXD1
A  [   931      3      1   2442   2447      0      0   2232     92 ]
C  [   614   1080     45      0      0      0     16      0   1408 ]
G  [   892    385      0      5      0      0     25    213    815 ]
T  [    10    979   2401      0      0   2447   2406      2    132 ]
>MA1506.1	HOXD10
A  [  1258   1102      0     32   1273      0   4645   4645   4645   4645   1316 ]
C  [   528    412     40   4645      1      0      0      0     36    463   1450 ]
G  [  2400   4645      2      0   4645    151     18      0      0    262    483 ]
T  [   459      0   4645      0      0   4645    370      0      7    728   1396 ]
>MA1506.2	HOXD10
A  [  1258   1102      0     32   1273      0   4645   4645   4645   4645 ]
C  [   528    412     40   4645      1      0      0      0     36    463 ]
G  [  2400   4645      2      0   4645    151     18      0      0    262 ]
T  [   459      0   4645      0      0   4645    370      0      7    728 ]
>UN1067.1	HOXD10::FLI1
A  [  1305   2077     14     42   7579   7164   1265     84   2109   3255     46   5141   7329   6638 ]
C  [  5054   5446      8     11     13     77     63    987   4834    133     83    168     78    363 ]
G  [  1200     98   7632   7549      6     51   6322     19    267   4203    264     95     55    124 ]
T  [   102     40      7     59     63    369     11   6571    451     70   7268   2257    199    536 ]
>UN1068.1	HOXD10::GABPA
A  [   195    120     23     53   1931   1879    194     38    633   1097     33   1441   1933   1775   1325 ]
C  [  1576   1901     32     70     71     71    120    301   1282     47     40     66     82    144    299 ]
G  [   301     65   2052   1871     29     51   1794     10    112    944     59     46     64     59    208 ]
T  [    52     38     17    130     93    123     16   1775     97     36   1992    571     45    146    292 ]
>UN0902.1	HOXD10::MEIS3
A  [   244      6    206    280    297    141     77      3     15     13      5    276 ]
C  [    25     23     59     21     22     84    184     40      2     34    321     18 ]
G  [    27      7     14     20     15     74     63      4    328      2     16     31 ]
T  [    56    316     73     31     18     53     28    305      7    303     10     27 ]
>UN1069.1	HOXD10::TGIF2LX
A  [   383   1380   2679     24   3237   4499   4510   1944    782     24     46    145     29   4368 ]
C  [  1420   2880    110     62    273     63     92    814   3404    456     18     62   4715     62 ]
G  [   141    208   1923     31    107     33     56    698    561     20   4690     19     25    223 ]
T  [  2830    306     62   4657   1157    179    116   1318     27   4274     20   4548      5    121 ]
>MA0908.1	HOXD11
A  [   128      0     16     68      8    175    230    230    230     88 ]
C  [    54      0    230      0      0      0      0      4     29     51 ]
G  [   230      0      0    230      0      0      0      0     28     23 ]
T  [     0    230     23      0    230     56      3      7     71     69 ]