MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0650.2 HOXA13 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 953 E= 0 0.308499 0.368311 0.304302 0.018888 0.049567 0.750590 0.199843 0.000000 0.000000 0.946429 0.000000 0.053571 0.707715 0.292285 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.982492 0.000000 0.017508 0.000000 0.998953 0.000000 0.001047 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.724374 0.186029 0.027335 0.062263 0.156800 0.606400 0.081600 0.155200 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0650.2 MOTIF UN1052.1 HOXA1::FLI1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 19 nsites= 1931 E= 0 0.562403 0.064215 0.247022 0.126359 0.176592 0.595546 0.191093 0.036769 0.201968 0.788193 0.008804 0.001036 0.002071 0.000000 0.995857 0.002071 0.000000 0.000000 0.996375 0.003625 0.974107 0.007250 0.003625 0.015018 0.764889 0.021750 0.003625 0.209736 0.503884 0.042465 0.447437 0.006214 0.052305 0.332988 0.085966 0.528742 0.268255 0.191093 0.366132 0.174521 0.302434 0.221129 0.290005 0.186432 0.236147 0.165199 0.269808 0.328845 0.105127 0.081305 0.106680 0.706888 0.087519 0.027447 0.036769 0.848265 0.336613 0.035215 0.044019 0.584153 0.915070 0.040394 0.025375 0.019161 0.148110 0.365096 0.054376 0.432418 0.113931 0.073019 0.552563 0.260487 0.428793 0.066287 0.374935 0.129984 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/UN1052.1 MOTIF MA0900.1 HOXA2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 8986 E= 0 0.244380 0.291453 0.263744 0.200423 0.175161 0.377699 0.296350 0.150790 0.087082 0.265667 0.049308 0.597943 0.595265 0.317854 0.066152 0.020730 0.911165 0.034885 0.049792 0.004158 0.000000 0.000000 0.000667 0.999333 0.015491 0.119985 0.000000 0.864524 0.947085 0.014230 0.003268 0.035417 0.243517 0.317084 0.316082 0.123317 0.182506 0.421322 0.227020 0.169152 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0900.1 MOTIF MA0900.2 HOXA2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 56949 E= 0 0.155929 0.341569 0.398356 0.104146 0.000000 0.060015 0.000000 0.939985 0.693129 0.301805 0.005066 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.965221 0.000000 0.034779 0.000000 0.186855 0.286753 0.390637 0.135755 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0900.2 MOTIF MA0900.3 HOXA2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 60585 E= 0 0.000000 0.060015 0.000000 0.939985 0.693129 0.301805 0.005066 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.965221 0.000000 0.034779 0.000000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0900.3 MOTIF UN1055.1 HOXA2::TBX20 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 2037 E= 0 0.709867 0.035837 0.178694 0.075601 0.139421 0.237604 0.431026 0.191949 0.030437 0.100147 0.808051 0.061365 0.020619 0.167894 0.015709 0.795778 0.018655 0.012273 0.962690 0.006382 0.151203 0.303878 0.036328 0.508591 0.040746 0.046146 0.016200 0.896907 0.890525 0.002946 0.100638 0.005891 0.955817 0.007855 0.028473 0.007855 0.020128 0.026510 0.075601 0.877761 0.038292 0.085420 0.213058 0.663230 0.514482 0.042710 0.392734 0.050074 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/UN1055.1 MOTIF UN1056.1 HOXA2::TBX21 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 11743 E= 0 0.124500 0.020523 0.030231 0.824747 0.818190 0.019756 0.126033 0.036021 0.941667 0.015754 0.027080 0.015499 0.061569 0.160266 0.024951 0.753215 0.019586 0.013966 0.558120 0.408328 0.954015 0.002384 0.035936 0.007664 0.132164 0.048710 0.709103 0.110023 0.001959 0.015669 0.977519 0.004854 0.002555 0.028102 0.001788 0.967555 0.001107 0.000085 0.998297 0.000511 0.060462 0.259474 0.017713 0.662352 0.016265 0.095206 0.593801 0.294729 0.908286 0.005706 0.070936 0.015073 0.624202 0.144171 0.095802 0.135826 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/UN1056.1 MOTIF UN1057.1 HOXA2::TBX4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 9685 E= 0 0.062261 0.037790 0.006195 0.893753 0.759525 0.009809 0.193598 0.037068 0.941972 0.018172 0.036035 0.003820 0.041920 0.119050 0.024264 0.814765 0.017037 0.007537 0.498193 0.477233 0.963965 0.000516 0.031699 0.003820 0.185958 0.045121 0.722767 0.046154 0.001033 0.004956 0.994011 0.000000 0.001446 0.013939 0.002788 0.981828 0.000620 0.000000 0.994837 0.004543 0.095509 0.153433 0.018792 0.732266 0.027362 0.144760 0.377697 0.450181 0.734538 0.008880 0.188539 0.068043 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/UN1057.1 MOTIF MA2119.1 HOXA3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 2771 E= 0 0.033562 0.449657 0.466979 0.049802 0.000000 0.165023 0.000000 0.834977 0.711086 0.286114 0.002800 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.169120 0.830880 0.875560 0.000000 0.124440 0.000000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA2119.1 MOTIF MA1496.1 HOXA4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 2945 E= 0 0.369779 0.134805 0.463497 0.031919 0.000000 0.282666 0.000000 0.717334 0.339544 0.593536 0.066920 0.000000 0.782027 0.000000 0.217973 0.000000 0.000000 0.000000 0.015644 0.984356 0.000000 0.061830 0.061115 0.877055 0.858042 0.051049 0.090909 0.000000 0.259169 0.241646 0.342298 0.156887 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1496.1