MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF MA1496.2 HOXA4
letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 2945 E= 0
 0.369779  0.134805  0.463497  0.031919
 0.000000  0.282666  0.000000  0.717334
 0.339544  0.593536  0.066920  0.000000
 0.782027  0.000000  0.217973  0.000000
 0.000000  0.000000  0.015644  0.984356
 0.000000  0.061830  0.061115  0.877055
 0.858042  0.051049  0.090909  0.000000
URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1496.2

MOTIF MA0158.1 HOXA5
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 15 E= 0
 0.133333  0.866667  0.000000  0.000000
 0.437500  0.000000  0.312500  0.250000
 0.000000  0.437500  0.312500  0.250000
 0.375000  0.000000  0.062500  0.562500
 0.875000  0.000000  0.000000  0.125000
 0.875000  0.000000  0.125000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.062500  0.375000  0.562500
URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0158.1

MOTIF MA0158.2 HOXA5
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 3130 E= 0
 0.045367  0.265815  0.561981  0.126837
 0.000000  0.336102  0.000000  0.663898
 0.646294  0.336981  0.016725  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  0.220423  0.779577
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.153355  0.467412  0.361981  0.017252
URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0158.2

MOTIF MA1497.1 HOXA6
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 7201 E= 0
 0.177059  0.221497  0.378836  0.222608
 0.112656  0.145349  0.606758  0.135238
 0.011776  0.401597  0.013535  0.573091
 0.542081  0.283650  0.062707  0.111563
 0.812296  0.084038  0.102425  0.001241
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.193069  0.023540  0.055870  0.727521
 0.851182  0.011111  0.059338  0.078369
 0.374948  0.191223  0.226635  0.207193
 0.171389  0.341250  0.280556  0.206806
URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1497.1

MOTIF MA1497.2 HOXA6
letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 11868 E= 0
 0.112656  0.145349  0.606758  0.135238
 0.011776  0.401597  0.013535  0.573091
 0.542081  0.283650  0.062707  0.111563
 0.812296  0.084038  0.102425  0.001241
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.193069  0.023540  0.055870  0.727521
 0.851182  0.011111  0.059338  0.078369
URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1497.2

MOTIF UN1058.1 HOXA6::TBX4
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 596 E= 0
 0.161074  0.112416  0.112416  0.614094
 0.548658  0.095638  0.129195  0.226510
 0.833893  0.031879  0.090604  0.043624
 0.067114  0.130872  0.120805  0.681208
 0.062081  0.030201  0.394295  0.513423
 0.734899  0.011745  0.209732  0.043624
 0.132550  0.140940  0.562081  0.164430
 0.025168  0.088926  0.862416  0.023490
 0.010067  0.060403  0.008389  0.921141
 0.030201  0.006711  0.949664  0.013423
 0.248322  0.152685  0.068792  0.530201
URL https://jaspar.elixir.no/matrix/UN1058.1

MOTIF MA1498.1 HOXA7
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 4227 E= 0
 0.113792  0.198486  0.544594  0.143128
 0.000000  0.547450  0.002125  0.450425
 0.515174  0.406459  0.050823  0.027544
 0.942895  0.018514  0.005577  0.033014
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.030571  0.000000  0.156701  0.812728
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.195884  0.406908  0.231133  0.166075
URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1498.1

MOTIF MA1498.2 HOXA7
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 8075 E= 0
 0.180681  0.283715  0.410650  0.124954
 0.114292  0.527094  0.032745  0.325869
 0.472331  0.385343  0.055762  0.086564
 0.877527  0.021626  0.067594  0.033254
 0.000248  0.000000  0.000000  0.999752
 0.104544  0.046172  0.000000  0.849285
 0.840183  0.049735  0.026220  0.083862
 0.391827  0.258328  0.201115  0.148731
URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1498.2

MOTIF MA1498.3 HOXA7
letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 9467 E= 0
 0.114292  0.527094  0.032745  0.325869
 0.472331  0.385343  0.055762  0.086564
 0.877527  0.021626  0.067594  0.033254
 0.000248  0.000000  0.000000  0.999752
 0.104544  0.046172  0.000000  0.849285
 0.840183  0.049735  0.026220  0.083862
URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1498.3

MOTIF MA0594.2 HOXA9
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 2058 E= 0
 0.316327  0.185131  0.482507  0.016035
 0.106538  0.205385  0.055769  0.632308
 0.042588  0.909292  0.008850  0.039270
 0.274038  0.007430  0.718531  0.000000
 0.000000  0.027794  0.000000  0.972206
 0.529810  0.039639  0.023848  0.406703
 0.851813  0.044560  0.011917  0.091710
 0.455654  0.242239  0.059590  0.242517
 0.225061  0.295012  0.204380  0.275547
 0.212895  0.273114  0.302920  0.211071
URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0594.2

