MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0485.2 HOXC9 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 21648 E= 0 0.200804 0.081301 0.717895 0.000000 0.000000 0.009370 0.000000 0.990630 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.214744 0.000000 0.785256 0.000000 0.000321 0.000321 0.000707 0.998651 0.881259 0.000000 0.000000 0.118741 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.999228 0.000772 0.000000 0.000000 0.691295 0.090432 0.060762 0.157511 0.209510 0.324110 0.140982 0.325397 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0485.2 MOTIF MA0485.3 HOXC9 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 21648 E= 0 0.200804 0.081301 0.717895 0.000000 0.000000 0.009370 0.000000 0.990630 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.214744 0.000000 0.785256 0.000000 0.000321 0.000321 0.000707 0.998651 0.881259 0.000000 0.000000 0.118741 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.999228 0.000772 0.000000 0.000000 0.691295 0.090432 0.060762 0.157511 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0485.3 MOTIF MA2677.1 HOXD1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 2447 E= 0 0.380466 0.250919 0.364528 0.004087 0.001226 0.441357 0.157336 0.400082 0.000409 0.018390 0.000000 0.981201 0.997957 0.000000 0.002043 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.006539 0.010217 0.983245 0.912137 0.000000 0.087045 0.000817 0.037597 0.575398 0.333061 0.053944 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA2677.1 MOTIF MA1506.1 HOXD10 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 4645 E= 0 0.270829 0.113671 0.516685 0.098816 0.178925 0.066894 0.754181 0.000000 0.000000 0.008534 0.000427 0.991039 0.006842 0.993158 0.000000 0.000000 0.215070 0.000169 0.784761 0.000000 0.000000 0.000000 0.031485 0.968515 0.922909 0.000000 0.003576 0.073515 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.990828 0.007679 0.000000 0.001493 0.761725 0.075927 0.042965 0.119383 0.283315 0.312164 0.103983 0.300538 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1506.1 MOTIF MA1506.2 HOXD10 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 4645 E= 0 0.270829 0.113671 0.516685 0.098816 0.178925 0.066894 0.754181 0.000000 0.000000 0.008534 0.000427 0.991039 0.006842 0.993158 0.000000 0.000000 0.215070 0.000169 0.784761 0.000000 0.000000 0.000000 0.031485 0.968515 0.922909 0.000000 0.003576 0.073515 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.990828 0.007679 0.000000 0.001493 0.761725 0.075927 0.042965 0.119383 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1506.2 MOTIF UN1067.1 HOXD10::FLI1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 7661 E= 0 0.170343 0.659705 0.156638 0.013314 0.271113 0.710873 0.012792 0.005221 0.001827 0.001044 0.996215 0.000914 0.005482 0.001436 0.985380 0.007701 0.989296 0.001697 0.000783 0.008223 0.935126 0.010051 0.006657 0.048166 0.165122 0.008223 0.825219 0.001436 0.010965 0.128834 0.002480 0.857721 0.275290 0.630988 0.034852 0.058870 0.424879 0.017361 0.548623 0.009137 0.006004 0.010834 0.034460 0.948701 0.671061 0.021929 0.012400 0.294609 0.956664 0.010181 0.007179 0.025976 0.866467 0.047383 0.016186 0.069965 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/UN1067.1 MOTIF UN1068.1 HOXD10::GABPA letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 2124 E= 0 0.091808 0.741996 0.141714 0.024482 0.056497 0.895009 0.030603 0.017891 0.010829 0.015066 0.966102 0.008004 0.024953 0.032957 0.880885 0.061205 0.909134 0.033427 0.013653 0.043785 0.884652 0.033427 0.024011 0.057910 0.091337 0.056497 0.844633 0.007533 0.017891 0.141714 0.004708 0.835687 0.298023 0.603578 0.052731 0.045669 0.516478 0.022128 0.444444 0.016949 0.015537 0.018832 0.027778 0.937853 0.678437 0.031073 0.021657 0.268832 0.910075 0.038606 0.030132 0.021186 0.835687 0.067797 0.027778 0.068738 0.623823 0.140772 0.097928 0.137476 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/UN1068.1 MOTIF UN0902.1 HOXD10::MEIS3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 352 E= 0 0.693182 0.071023 0.076705 0.159091 0.017045 0.065341 0.019886 0.897727 0.585227 0.167614 0.039773 0.207386 0.795455 0.059659 0.056818 0.088068 0.843750 0.062500 0.042614 0.051136 0.400568 0.238636 0.210227 0.150568 0.218750 0.522727 0.178977 0.079545 0.008523 0.113636 0.011364 0.866477 0.042614 0.005682 0.931818 0.019886 0.036932 0.096591 0.005682 0.860795 0.014205 0.911932 0.045455 0.028409 0.784091 0.051136 0.088068 0.076705 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/UN0902.1 MOTIF UN1069.1 HOXD10::TGIF2LX letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 4774 E= 0 0.080226 0.297444 0.029535 0.592794 0.289066 0.603268 0.043569 0.064097 0.561165 0.023041 0.402807 0.012987 0.005027 0.012987 0.006494 0.975492 0.678048 0.057185 0.022413 0.242354 0.942396 0.013196 0.006912 0.037495 0.944700 0.019271 0.011730 0.024298 0.407206 0.170507 0.146209 0.276079 0.163804 0.713029 0.117512 0.005656 0.005027 0.095517 0.004189 0.895266 0.009636 0.003770 0.982405 0.004189 0.030373 0.012987 0.003980 0.952660 0.006075 0.987641 0.005237 0.001047 0.914956 0.012987 0.046711 0.025346 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/UN1069.1 MOTIF MA0908.1 HOXD11 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 412 E= 0 0.310680 0.131068 0.558252 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.059480 0.855019 0.000000 0.085502 0.228188 0.000000 0.771812 0.000000 0.033613 0.000000 0.000000 0.966387 0.757576 0.000000 0.000000 0.242424 0.987124 0.000000 0.000000 0.012876 0.954357 0.016598 0.000000 0.029046 0.642458 0.081006 0.078212 0.198324 0.380952 0.220779 0.099567 0.298701 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0908.1