MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0910.3 HOXD8 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 3628 E= 0 0.148015 0.111632 0.630375 0.109978 0.000000 0.592287 0.000000 0.407713 0.543101 0.449865 0.007034 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.041261 0.000000 0.117524 0.841215 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0910.3 MOTIF MA0913.2 HOXD9 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 19190 E= 0 0.067744 0.045440 0.852684 0.034132 0.000000 0.595733 0.002560 0.401707 0.614965 0.324827 0.025368 0.034839 0.960721 0.013269 0.025775 0.000235 0.012969 0.000000 0.000000 0.987031 0.750046 0.000367 0.000000 0.249587 0.992539 0.000000 0.000000 0.007461 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.744619 0.100205 0.055336 0.099841 0.253560 0.354703 0.132555 0.259182 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0913.2 MOTIF MA0913.3 HOXD9 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 19190 E= 0 0.067744 0.045440 0.852684 0.034132 0.000000 0.595733 0.002560 0.401707 0.614965 0.324827 0.025368 0.034839 0.960721 0.013269 0.025775 0.000235 0.012969 0.000000 0.000000 0.987031 0.750046 0.000367 0.000000 0.249587 0.992539 0.000000 0.000000 0.007461 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.744619 0.100205 0.055336 0.099841 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0913.3 MOTIF UN1074.1 HOXD9::TBX21 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 545 E= 0 0.099083 0.093578 0.128440 0.678899 0.023853 0.124771 0.025688 0.825688 0.429358 0.023853 0.102752 0.444037 0.860550 0.025688 0.086239 0.027523 0.060550 0.400000 0.047706 0.491743 0.034862 0.016514 0.840367 0.108257 0.845872 0.000000 0.154128 0.000000 0.040367 0.100917 0.629358 0.229358 0.000000 0.016514 0.959633 0.023853 0.000000 0.001835 0.000000 0.998165 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.018349 0.251376 0.020183 0.710092 0.014679 0.040367 0.642202 0.302752 0.884404 0.023853 0.071560 0.020183 0.680734 0.073394 0.119266 0.126606 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/UN1074.1 MOTIF UN0903.1 HOXD9::TGIF2LX letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 3999 E= 0 0.215054 0.222306 0.505126 0.057514 0.123781 0.430608 0.035259 0.410353 0.342586 0.562141 0.034759 0.060515 0.643661 0.045011 0.300325 0.011003 0.004501 0.025506 0.004001 0.965991 0.628657 0.110028 0.024756 0.236559 0.911978 0.019505 0.012753 0.055764 0.945486 0.015254 0.015004 0.024256 0.403601 0.199550 0.132783 0.264066 0.178295 0.726432 0.087272 0.008002 0.007752 0.113528 0.002001 0.876719 0.009252 0.000250 0.989497 0.001000 0.010253 0.009752 0.001500 0.978495 0.001500 0.994499 0.002001 0.002001 0.937484 0.013253 0.032008 0.017254 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/UN0903.1 MOTIF MA1387.1 HRS1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 596 E= 0 0.392617 0.142617 0.216443 0.248322 0.211409 0.110738 0.486577 0.191275 0.436242 0.117450 0.154362 0.291946 0.657718 0.080537 0.075503 0.186242 0.169463 0.119128 0.057047 0.654362 0.221477 0.506711 0.162752 0.109060 0.241611 0.169463 0.419463 0.169463 0.709732 0.053691 0.102349 0.134228 0.919463 0.000000 0.033557 0.046980 0.000000 0.000000 0.679530 0.320470 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.041946 0.036913 0.006711 0.914430 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.072148 0.419463 0.046980 0.461409 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1387.1 MOTIF MA1387.2 HRS1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 596 E= 0 0.657718 0.080537 0.075503 0.186242 0.169463 0.119128 0.057047 0.654362 0.221477 0.506711 0.162752 0.109060 0.241611 0.169463 0.419463 0.169463 0.709732 0.053691 0.102349 0.134228 0.919463 0.000000 0.033557 0.046980 0.000000 0.000000 0.679530 0.320470 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.041946 0.036913 0.006711 0.914430 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.072148 0.419463 0.046980 0.461409 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1387.2 MOTIF UN1282.1 HSF-U letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 27551 E= 0 0.437734 0.010199 0.523901 0.028166 0.012196 0.005844 0.980219 0.001742 0.993648 0.001597 0.002867 0.001887 0.987296 0.000871 0.003811 0.008021 0.003702 0.015499 0.971144 0.009655 0.204312 0.172553 0.472397 0.150739 0.001851 0.003993 0.001706 0.992450 0.000871 0.002831 0.001815 0.994483 0.002504 0.988204 0.004573 0.004719 0.028710 0.415121 0.018184 0.537984 0.568219 0.134224 0.235999 0.061559 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/UN1282.1 MOTIF MA0319.1 HSF1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 101 E= 0 0.683168 0.128713 0.128713 0.059406 0.019802 0.019802 0.019802 0.940594 0.190000 0.000000 0.810000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.060000 0.560000 0.190000 0.190000 0.484848 0.111111 0.232323 0.171717 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0319.1 MOTIF MA0486.1 HSF1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 225 E= 0 0.111111 0.364444 0.248889 0.275556 0.035556 0.115556 0.053333 0.795556 0.013333 0.048889 0.035556 0.902222 0.004444 0.986667 0.008889 0.000000 0.017778 0.315556 0.026667 0.640000 0.568889 0.031111 0.395556 0.004444 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.831111 0.106667 0.013333 0.048889 0.826667 0.026667 0.066667 0.080000 0.195556 0.280000 0.324444 0.200000 0.173333 0.275556 0.297778 0.253333 0.057778 0.071111 0.040000 0.831111 0.035556 0.022222 0.017778 0.924444 0.000000 0.968889 0.008889 0.022222 0.026667 0.391111 0.080000 0.502222 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0486.1