MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA1880.2 Hey letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1000 E= 0 0.027000 0.921000 0.026000 0.026000 0.870130 0.021978 0.085914 0.021978 0.015000 0.931000 0.017000 0.037000 0.035000 0.024000 0.922000 0.019000 0.019019 0.085085 0.016016 0.879880 0.032967 0.027972 0.910090 0.028971 0.094000 0.554000 0.119000 0.233000 0.125000 0.642000 0.132000 0.101000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1880.2 MOTIF MA0739.1 Hic1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 12392 E= 0 0.511378 0.058021 0.376856 0.053744 0.005361 0.036493 0.006313 0.951833 0.074639 0.046197 0.864786 0.014378 0.004473 0.984702 0.010825 0.000000 0.007861 0.983295 0.002769 0.006075 0.795268 0.176481 0.000265 0.027986 0.557827 0.180431 0.205960 0.055783 0.079510 0.717349 0.106165 0.096976 0.146257 0.438045 0.171148 0.244549 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0739.1 MOTIF MA0739.2 Hic1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 12392 E= 0 0.511378 0.058021 0.376856 0.053744 0.005361 0.036493 0.006313 0.951833 0.074639 0.046197 0.864786 0.014378 0.004473 0.984702 0.010825 0.000000 0.007861 0.983295 0.002769 0.006075 0.795268 0.176481 0.000265 0.027986 0.557827 0.180431 0.205960 0.055783 0.079510 0.717349 0.106165 0.096976 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0739.2 MOTIF MA1881.1 Hmbox1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1000 E= 0 0.260000 0.225000 0.265000 0.250000 0.268268 0.227227 0.251251 0.253253 0.261000 0.231000 0.245000 0.263000 0.265000 0.220000 0.237000 0.278000 0.280000 0.195000 0.204000 0.321000 0.393000 0.163000 0.195000 0.249000 0.407000 0.151000 0.167000 0.275000 0.097000 0.086000 0.090000 0.727000 0.040040 0.030030 0.014014 0.915916 0.891000 0.027000 0.030000 0.052000 0.929000 0.017000 0.024000 0.030000 0.048000 0.023000 0.025000 0.904000 0.076000 0.042000 0.041000 0.841000 0.523524 0.089089 0.190190 0.197197 0.331000 0.211000 0.225000 0.233000 0.280000 0.205000 0.221000 0.294000 0.241000 0.216000 0.207000 0.336000 0.247752 0.226773 0.220779 0.304695 0.245000 0.232000 0.234000 0.289000 0.245000 0.239000 0.245000 0.271000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1881.1 MOTIF MA1881.2 Hmbox1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 1000 E= 0 0.097000 0.086000 0.090000 0.727000 0.040040 0.030030 0.014014 0.915916 0.891000 0.027000 0.030000 0.052000 0.929000 0.017000 0.024000 0.030000 0.048000 0.023000 0.025000 0.904000 0.076000 0.042000 0.041000 0.841000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1881.2 MOTIF MA2124.1 Hmga1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 25806 E= 0 0.970743 0.002751 0.007285 0.019220 0.031776 0.015229 0.016314 0.936681 0.040068 0.007750 0.011741 0.940440 0.026932 0.007518 0.005348 0.960203 0.025227 0.010230 0.009184 0.955359 0.029838 0.015849 0.011393 0.942920 0.946795 0.018329 0.013873 0.021003 0.375107 0.090987 0.094474 0.439433 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA2124.1 MOTIF MA0192.1 Hmx letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 20 E= 0 0.050000 0.150000 0.000000 0.800000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.050000 0.000000 0.000000 0.950000 0.000000 0.150000 0.000000 0.850000 0.200000 0.000000 0.800000 0.000000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0192.1 MOTIF MA0896.1 Hmx1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.340000 0.290000 0.240000 0.130000 0.170000 0.430000 0.270000 0.130000 0.360000 0.290000 0.260000 0.090000 0.690000 0.060000 0.160000 0.090000 0.130000 0.080000 0.720000 0.070000 0.010000 0.950000 0.000000 0.040000 0.870000 0.000000 0.120000 0.010000 0.880000 0.110000 0.000000 0.010000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.019802 0.059406 0.000000 0.920792 0.959596 0.000000 0.010101 0.030303 0.888889 0.010101 0.040404 0.060606 0.250000 0.150000 0.170000 0.430000 0.141414 0.222222 0.505051 0.131313 0.383838 0.292929 0.282828 0.040404 0.326733 0.128713 0.237624 0.306931 0.180000 0.200000 0.220000 0.400000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0896.1 MOTIF MA0896.2 Hmx1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 0 0.690000 0.060000 0.160000 0.090000 0.130000 0.080000 0.720000 0.070000 0.010000 0.950000 0.000000 0.040000 0.870000 0.000000 0.120000 0.010000 0.880000 0.110000 0.000000 0.010000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.019802 0.059406 0.000000 0.920792 0.959596 0.000000 0.010101 0.030303 0.888889 0.010101 0.040404 0.060606 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0896.2 MOTIF MA0897.1 Hmx2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.500000 0.200000 0.230000 0.070000 0.190000 0.440000 0.230000 0.140000 0.550000 0.190000 0.170000 0.090000 0.762376 0.059406 0.118812 0.059406 0.170000 0.150000 0.570000 0.110000 0.010101 0.979798 0.000000 0.010101 0.850000 0.000000 0.150000 0.000000 0.850000 0.130000 0.010000 0.010000 0.010000 0.000000 0.000000 0.990000 0.019802 0.059406 0.000000 0.920792 0.939394 0.000000 0.010101 0.050505 0.890000 0.010000 0.020000 0.080000 0.360000 0.190000 0.110000 0.340000 0.247525 0.207921 0.405941 0.138614 0.410000 0.270000 0.270000 0.050000 0.470000 0.100000 0.250000 0.180000 0.090909 0.070707 0.090909 0.747475 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0897.1