MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0897.2 Hmx2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 100 E= 0 0.550000 0.190000 0.170000 0.090000 0.762376 0.059406 0.118812 0.059406 0.170000 0.150000 0.570000 0.110000 0.010101 0.979798 0.000000 0.010101 0.850000 0.000000 0.150000 0.000000 0.850000 0.130000 0.010000 0.010000 0.010000 0.000000 0.000000 0.990000 0.019802 0.059406 0.000000 0.920792 0.939394 0.000000 0.010101 0.050505 0.890000 0.010000 0.020000 0.080000 0.360000 0.190000 0.110000 0.340000 0.247525 0.207921 0.405941 0.138614 0.410000 0.270000 0.270000 0.050000 0.470000 0.100000 0.250000 0.180000 0.090909 0.070707 0.090909 0.747475 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0897.2 MOTIF MA0898.1 Hmx3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.490000 0.210000 0.210000 0.090000 0.121212 0.494949 0.252525 0.131313 0.480000 0.230000 0.190000 0.100000 0.760000 0.070000 0.110000 0.060000 0.151515 0.101010 0.595960 0.151515 0.020000 0.940000 0.000000 0.040000 0.831683 0.000000 0.158416 0.009901 0.870000 0.120000 0.000000 0.010000 0.010000 0.000000 0.000000 0.990000 0.010101 0.040404 0.000000 0.949495 0.929293 0.000000 0.020202 0.050505 0.878788 0.020202 0.030303 0.070707 0.386139 0.148515 0.118812 0.346535 0.260000 0.180000 0.380000 0.180000 0.470000 0.210000 0.260000 0.060000 0.520000 0.110000 0.180000 0.190000 0.130000 0.100000 0.130000 0.640000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0898.1 MOTIF MA0898.2 Hmx3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 0 0.760000 0.070000 0.110000 0.060000 0.151515 0.101010 0.595960 0.151515 0.020000 0.940000 0.000000 0.040000 0.831683 0.000000 0.158416 0.009901 0.870000 0.120000 0.000000 0.010000 0.010000 0.000000 0.000000 0.990000 0.010101 0.040404 0.000000 0.949495 0.929293 0.000000 0.020202 0.050505 0.878788 0.020202 0.030303 0.070707 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0898.2 MOTIF MA1882.1 Hnf1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1000 E= 0 0.452000 0.095000 0.103000 0.350000 0.322000 0.115000 0.122000 0.441000 0.290000 0.149000 0.166000 0.395000 0.307000 0.192000 0.204000 0.297000 0.273000 0.203000 0.186000 0.338000 0.371628 0.213786 0.187812 0.226773 0.386000 0.200000 0.239000 0.175000 0.102000 0.170000 0.121000 0.607000 0.029000 0.032000 0.008000 0.931000 0.946000 0.016000 0.022000 0.016000 0.942000 0.013000 0.027000 0.018000 0.024024 0.035035 0.024024 0.916917 0.038000 0.029000 0.055000 0.878000 0.540000 0.068000 0.254000 0.138000 0.288288 0.253253 0.262262 0.196196 0.260000 0.241000 0.204000 0.295000 0.307000 0.197000 0.186000 0.310000 0.307000 0.177000 0.158000 0.358000 0.320000 0.144000 0.136000 0.400000 0.420000 0.117000 0.117000 0.346000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1882.1 MOTIF MA1882.2 Hnf1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 1000 E= 0 0.102000 0.170000 0.121000 0.607000 0.029000 0.032000 0.008000 0.931000 0.946000 0.016000 0.022000 0.016000 0.942000 0.013000 0.027000 0.018000 0.024024 0.035035 0.024024 0.916917 0.038000 0.029000 0.055000 0.878000 0.540000 0.068000 0.254000 0.138000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1882.2 MOTIF MA1991.1 Hnf1A letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 1249 E= 0 0.188151 0.253002 0.255404 0.303443 0.141713 0.278623 0.309047 0.270616 0.082466 0.595677 0.163331 0.158527 0.014412 0.904724 0.031225 0.049640 0.015212 0.024019 0.005604 0.955164 0.012810 0.040833 0.048038 0.898319 0.012810 0.008807 0.009608 0.968775 0.024019 0.094476 0.827062 0.054444 0.900721 0.028022 0.012810 0.058447 0.084067 0.016813 0.024820 0.874299 0.068054 0.551641 0.301841 0.078463 0.124900 0.168135 0.079263 0.627702 0.144115 0.285028 0.279424 0.291433 0.200961 0.244195 0.281025 0.273819 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1991.1 MOTIF MA1991.2 Hnf1A letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1249 E= 0 0.082466 0.595677 0.163331 0.158527 0.014412 0.904724 0.031225 0.049640 0.015212 0.024019 0.005604 0.955164 0.012810 0.040833 0.048038 0.898319 0.012810 0.008807 0.009608 0.968775 0.024019 0.094476 0.827062 0.054444 0.900721 0.028022 0.012810 0.058447 0.084067 0.016813 0.024820 0.874299 0.068054 0.551641 0.301841 0.078463 0.124900 0.168135 0.079263 0.627702 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1991.2 MOTIF MA2242.1 Hnf4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 999 E= 0 0.458438 0.003778 0.533375 0.004408 0.001368 0.000000 0.995896 0.002736 0.016393 0.001261 0.918033 0.064313 0.035828 0.020701 0.363854 0.579618 0.000000 0.950392 0.003916 0.045692 0.956636 0.001314 0.040736 0.001314 0.994498 0.000000 0.002751 0.002751 0.981132 0.006739 0.012129 0.000000 0.006748 0.010796 0.982456 0.000000 0.016512 0.005160 0.751290 0.227038 0.009877 0.004938 0.086420 0.898765 0.001264 0.920354 0.006321 0.072061 0.844548 0.001160 0.149652 0.004640 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA2242.1 MOTIF MA0114.3 Hnf4a letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 6216 E= 0 0.300837 0.094434 0.529601 0.075129 0.312909 0.004432 0.681696 0.000963 0.001161 0.000000 0.998646 0.000193 0.034602 0.002296 0.846507 0.116596 0.024916 0.011111 0.094949 0.869024 0.000189 0.975803 0.000945 0.023062 0.969754 0.000376 0.029870 0.000000 0.984739 0.000000 0.013163 0.002098 0.990027 0.000000 0.009973 0.000000 0.000000 0.000194 0.999226 0.000581 0.000000 0.000966 0.001353 0.997681 0.020207 0.808584 0.020520 0.150689 0.000000 0.963599 0.000747 0.035654 0.835115 0.006565 0.132996 0.025324 0.416118 0.214839 0.217164 0.151879 0.197366 0.206082 0.175479 0.421073 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0114.3 MOTIF MA1883.1 Hox1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 999 E= 0 0.284284 0.191191 0.219219 0.305305 0.284000 0.193000 0.221000 0.302000 0.284284 0.193193 0.225225 0.297297 0.271000 0.202000 0.227000 0.300000 0.267000 0.206000 0.213000 0.314000 0.307692 0.201798 0.219780 0.270729 0.344000 0.170000 0.218000 0.268000 0.081000 0.062000 0.076000 0.781000 0.053000 0.049000 0.032000 0.866000 0.859141 0.037962 0.048951 0.053946 0.891892 0.027027 0.031031 0.050050 0.057000 0.031000 0.035000 0.877000 0.059000 0.052000 0.066000 0.823000 0.361361 0.154154 0.240240 0.244244 0.287000 0.221000 0.228000 0.264000 0.268000 0.222000 0.209000 0.301000 0.274000 0.211000 0.208000 0.307000 0.283000 0.207000 0.207000 0.303000 0.286713 0.206793 0.207792 0.298701 0.286000 0.207000 0.206000 0.301000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1883.1