MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA1883.2 Hox1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 1000 E= 0 0.081000 0.062000 0.076000 0.781000 0.053000 0.049000 0.032000 0.866000 0.859141 0.037962 0.048951 0.053946 0.891892 0.027027 0.031031 0.050050 0.057000 0.031000 0.035000 0.877000 0.059000 0.052000 0.066000 0.823000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1883.2 MOTIF MA1884.1 Hox3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1000 E= 0 0.338000 0.162000 0.179000 0.321000 0.306000 0.163000 0.181000 0.350000 0.335000 0.183000 0.207000 0.275000 0.348000 0.183000 0.207000 0.262000 0.262737 0.239760 0.199800 0.297702 0.306000 0.229000 0.296000 0.169000 0.293000 0.223000 0.210000 0.274000 0.041958 0.022977 0.016983 0.918082 0.881000 0.019000 0.063000 0.037000 0.964000 0.009000 0.014000 0.013000 0.008000 0.052000 0.009000 0.931000 0.047000 0.063000 0.673000 0.217000 0.800200 0.051948 0.076923 0.070929 0.174000 0.242000 0.214000 0.370000 0.262000 0.236000 0.242000 0.260000 0.393606 0.173826 0.176823 0.255744 0.259000 0.187000 0.153000 0.401000 0.286000 0.177000 0.190000 0.347000 0.350000 0.162000 0.169000 0.319000 0.332000 0.179000 0.160000 0.329000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1884.1 MOTIF MA1884.2 Hox3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 1001 E= 0 0.041958 0.022977 0.016983 0.918082 0.881000 0.019000 0.063000 0.037000 0.964000 0.009000 0.014000 0.013000 0.008000 0.052000 0.009000 0.931000 0.047000 0.063000 0.673000 0.217000 0.800200 0.051948 0.076923 0.070929 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1884.2 MOTIF MA1885.1 Hox4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1000 E= 0 0.298000 0.194000 0.189000 0.319000 0.321000 0.191000 0.196000 0.292000 0.338661 0.193806 0.205794 0.261738 0.346000 0.184000 0.206000 0.264000 0.271000 0.228000 0.218000 0.283000 0.273726 0.223776 0.290709 0.211788 0.334000 0.197000 0.246000 0.223000 0.048000 0.078000 0.033000 0.841000 0.322677 0.597403 0.041958 0.037962 0.934000 0.010000 0.046000 0.010000 0.012987 0.011988 0.007992 0.967033 0.027000 0.029000 0.013000 0.931000 0.936937 0.016016 0.017017 0.030030 0.350000 0.184000 0.209000 0.257000 0.171171 0.292292 0.225225 0.311311 0.249000 0.202000 0.276000 0.273000 0.281000 0.220000 0.211000 0.288000 0.263263 0.224224 0.205205 0.307307 0.286000 0.217000 0.193000 0.304000 0.294000 0.205000 0.190000 0.311000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1885.1 MOTIF MA1885.2 Hox4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 1000 E= 0 0.048000 0.078000 0.033000 0.841000 0.322677 0.597403 0.041958 0.037962 0.934000 0.010000 0.046000 0.010000 0.012987 0.011988 0.007992 0.967033 0.027000 0.029000 0.013000 0.931000 0.936937 0.016016 0.017017 0.030030 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1885.2 MOTIF MA1886.1 Hox5 letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1000 E= 0 0.296000 0.199000 0.233000 0.272000 0.277722 0.198801 0.234765 0.288711 0.288000 0.203000 0.244000 0.265000 0.290000 0.210000 0.242000 0.258000 0.257742 0.241758 0.235764 0.264735 0.274000 0.224000 0.287000 0.215000 0.245000 0.214000 0.233000 0.308000 0.042000 0.029000 0.019000 0.910000 0.874000 0.025000 0.041000 0.060000 0.944945 0.011011 0.016016 0.028028 0.051000 0.020000 0.035000 0.894000 0.056000 0.053000 0.108000 0.783000 0.170829 0.036963 0.722278 0.069930 0.223776 0.270729 0.264735 0.240759 0.214785 0.241758 0.248751 0.294705 0.248000 0.225000 0.233000 0.294000 0.254000 0.211000 0.212000 0.323000 0.243243 0.204204 0.221221 0.331331 0.252000 0.202000 0.218000 0.328000 0.263000 0.199000 0.217000 0.321000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1886.1 MOTIF MA1886.2 Hox5 letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 1000 E= 0 0.042000 0.029000 0.019000 0.910000 0.874000 0.025000 0.041000 0.060000 0.944945 0.011011 0.016016 0.028028 0.051000 0.020000 0.035000 0.894000 0.056000 0.053000 0.108000 0.783000 0.170829 0.036963 0.722278 0.069930 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1886.2 MOTIF MA0911.1 Hoxa11 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 704 E= 0 0.252841 0.153409 0.436080 0.157670 0.235294 0.202703 0.559618 0.002385 0.001335 0.037383 0.021362 0.939920 0.038961 0.914286 0.000000 0.046753 0.259605 0.002077 0.731049 0.007269 0.019391 0.001385 0.004155 0.975069 0.679167 0.004167 0.018056 0.298611 0.955224 0.000000 0.002714 0.042062 0.909561 0.034884 0.003876 0.051680 0.598131 0.135089 0.099405 0.167375 0.254261 0.232955 0.213068 0.299716 0.197443 0.156250 0.159091 0.487216 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0911.1 MOTIF MA0911.2 Hoxa11 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 1258 E= 0 0.235294 0.202703 0.559618 0.002385 0.001335 0.037383 0.021362 0.939920 0.038961 0.914286 0.000000 0.046753 0.259605 0.002077 0.731049 0.007269 0.019391 0.001385 0.004155 0.975069 0.679167 0.004167 0.018056 0.298611 0.955224 0.000000 0.002714 0.042062 0.909561 0.034884 0.003876 0.051680 0.598131 0.135089 0.099405 0.167375 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0911.2 MOTIF MA0650.3 Hoxa13 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 17248 E= 0 0.323806 0.192138 0.224258 0.259798 0.249420 0.242521 0.264205 0.243854 0.083604 0.730519 0.109520 0.076357 0.073806 0.817486 0.004464 0.104244 0.815689 0.092417 0.008465 0.083430 0.893437 0.014089 0.038613 0.053861 0.006088 0.014436 0.013451 0.966025 0.916280 0.011885 0.023597 0.048237 0.974780 0.007247 0.005682 0.012291 0.959532 0.017741 0.008407 0.014321 0.442660 0.186688 0.159381 0.211271 0.304731 0.244318 0.175441 0.275510 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0650.3