MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0650.4 Hoxa13 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 17248 E= 0 0.083604 0.730519 0.109520 0.076357 0.073806 0.817486 0.004464 0.104244 0.815689 0.092417 0.008465 0.083430 0.893437 0.014089 0.038613 0.053861 0.006088 0.014436 0.013451 0.966025 0.916280 0.011885 0.023597 0.048237 0.974780 0.007247 0.005682 0.012291 0.959532 0.017741 0.008407 0.014321 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0650.4 MOTIF MA0594.1 Hoxa9 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 172 E= 0 0.197674 0.308140 0.470930 0.023256 0.069767 0.639535 0.029070 0.261628 0.220930 0.680233 0.000000 0.098837 0.936047 0.017442 0.046512 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.587209 0.337209 0.046512 0.029070 0.912791 0.034884 0.000000 0.052326 0.994186 0.005814 0.000000 0.000000 0.029070 0.000000 0.005814 0.965116 0.040698 0.895349 0.000000 0.063953 0.761628 0.063953 0.000000 0.174419 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0594.1 MOTIF MA0904.1 Hoxb5 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.520000 0.230000 0.140000 0.110000 0.270000 0.350000 0.190000 0.190000 0.168317 0.089109 0.643564 0.099010 0.120000 0.150000 0.380000 0.350000 0.010000 0.070000 0.000000 0.920000 0.909091 0.090909 0.000000 0.000000 0.980000 0.010000 0.000000 0.010000 0.010000 0.000000 0.010000 0.980000 0.000000 0.000000 0.090909 0.909091 0.920000 0.000000 0.070000 0.010000 0.190000 0.290000 0.410000 0.110000 0.099010 0.643564 0.089109 0.168317 0.282828 0.252525 0.101010 0.363636 0.280000 0.440000 0.110000 0.170000 0.673267 0.049505 0.138614 0.138614 0.220000 0.160000 0.140000 0.480000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0904.1 MOTIF MA0485.1 Hoxc9 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 885 E= 0 0.265537 0.124294 0.453107 0.157062 0.126554 0.193220 0.605650 0.074576 0.099435 0.683616 0.045198 0.171751 0.253107 0.528814 0.001130 0.216949 0.746893 0.003390 0.231638 0.018079 0.000000 0.010169 0.000000 0.989831 0.841808 0.094915 0.039548 0.023729 0.995480 0.000000 0.000000 0.004520 0.993220 0.006780 0.000000 0.000000 0.020339 0.000000 0.000000 0.979661 0.054237 0.807910 0.005650 0.132203 0.640678 0.081356 0.006780 0.271186 0.159322 0.371751 0.180791 0.288136 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0485.1 MOTIF MA0909.3 Hoxd13 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 5977 E= 0 0.293793 0.221349 0.243768 0.241091 0.229547 0.297474 0.287101 0.185879 0.002677 0.981429 0.005688 0.010206 0.966204 0.000837 0.024762 0.008198 0.990965 0.002175 0.001840 0.005019 0.000000 0.000335 0.000502 0.999163 0.996319 0.000669 0.001171 0.001840 0.990965 0.006190 0.000335 0.002510 0.707211 0.117785 0.063410 0.111594 0.414422 0.184875 0.185210 0.215493 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0909.3 MOTIF MA0909.4 Hoxd13 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 5977 E= 0 0.002677 0.981429 0.005688 0.010206 0.966204 0.000837 0.024762 0.008198 0.990965 0.002175 0.001840 0.005019 0.000000 0.000335 0.000502 0.999163 0.996319 0.000669 0.001171 0.001840 0.990965 0.006190 0.000335 0.002510 0.707211 0.117785 0.063410 0.111594 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0909.4 MOTIF MA0912.1 Hoxd3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.190000 0.370000 0.050000 0.390000 0.190000 0.080000 0.080000 0.650000 0.140000 0.100000 0.600000 0.160000 0.366337 0.099010 0.326733 0.207921 0.237624 0.089109 0.435644 0.237624 0.140000 0.240000 0.290000 0.330000 0.010101 0.141414 0.000000 0.848485 0.878788 0.121212 0.000000 0.000000 0.980000 0.010000 0.000000 0.010000 0.010000 0.000000 0.010000 0.980000 0.000000 0.000000 0.121212 0.878788 0.848485 0.000000 0.141414 0.010101 0.373737 0.373737 0.141414 0.111111 0.237624 0.435644 0.089109 0.237624 0.118812 0.366337 0.306931 0.207921 0.090000 0.220000 0.210000 0.480000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0912.1 MOTIF MA0910.1 Hoxd8 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.130000 0.120000 0.200000 0.550000 0.606061 0.121212 0.111111 0.161616 0.606061 0.080808 0.202020 0.111111 0.330000 0.050000 0.290000 0.330000 0.070000 0.230000 0.010000 0.690000 0.727273 0.121212 0.030303 0.121212 0.920000 0.020000 0.020000 0.040000 0.040000 0.010000 0.010000 0.940000 0.050000 0.010000 0.000000 0.940000 0.959596 0.000000 0.010101 0.030303 0.797980 0.050505 0.020202 0.131313 0.070000 0.090000 0.050000 0.790000 0.350000 0.040000 0.470000 0.140000 0.240000 0.070000 0.560000 0.130000 0.188119 0.495050 0.079208 0.237624 0.188119 0.089109 0.138614 0.584158 0.360000 0.210000 0.180000 0.250000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0910.1 MOTIF MA0913.1 Hoxd9 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 322 E= 0 0.232919 0.136646 0.602484 0.027950 0.047525 0.544554 0.023762 0.384158 0.631922 0.250814 0.117264 0.000000 0.836207 0.008621 0.133621 0.021552 0.058824 0.031674 0.031674 0.877828 0.502538 0.015228 0.000000 0.482234 0.910798 0.009390 0.000000 0.079812 0.932692 0.033654 0.000000 0.033654 0.638158 0.085526 0.131579 0.144737 0.425641 0.143590 0.097436 0.333333 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0913.1 MOTIF MA2243.1 Hr38 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 998 E= 0 0.792585 0.002004 0.103206 0.102204 0.920921 0.000000 0.004004 0.075075 0.995996 0.000000 0.003003 0.001001 0.000000 0.000000 0.788789 0.211211 0.009009 0.000000 0.976977 0.014014 0.008016 0.029058 0.104208 0.858717 0.002004 0.868737 0.013026 0.116232 0.896690 0.003009 0.091274 0.009027 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA2243.1