MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA2499.1 LSH2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 7050 E= 0 0.085532 0.113759 0.040284 0.760426 0.861418 0.043546 0.024681 0.070355 0.010071 0.961418 0.009645 0.018865 0.025248 0.006950 0.008652 0.959149 0.120142 0.009362 0.858865 0.011631 0.010922 0.013333 0.009504 0.966241 0.089504 0.007518 0.033050 0.869929 0.056454 0.753333 0.059858 0.130355 0.588794 0.159858 0.067660 0.183688 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA2499.1 MOTIF MA2500.1 LSH3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 4064 E= 0 0.141978 0.103346 0.085384 0.669291 0.063484 0.093504 0.040600 0.802411 0.870817 0.042569 0.027805 0.058809 0.013041 0.955217 0.011565 0.020177 0.017224 0.007136 0.008120 0.967520 0.069636 0.007382 0.908219 0.014764 0.010827 0.022638 0.010581 0.955955 0.105561 0.010581 0.035925 0.847933 0.058317 0.692175 0.096457 0.153051 0.728593 0.104823 0.039124 0.127461 0.138287 0.100148 0.072343 0.689222 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA2500.1 MOTIF MA0325.1 LYS14 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 101 E= 0 0.207921 0.485149 0.207921 0.099010 0.040000 0.820000 0.100000 0.040000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.060000 0.000000 0.000000 0.940000 0.128713 0.128713 0.069307 0.673267 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0325.1 MOTIF MA0325.2 LYS14 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 100 E= 0 0.040000 0.820000 0.100000 0.040000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.060000 0.000000 0.000000 0.940000 0.128713 0.128713 0.069307 0.673267 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0325.2 MOTIF MA0768.2 Lef1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 1081 E= 0 0.264570 0.221092 0.211841 0.302498 0.220167 0.207216 0.228492 0.344126 0.162812 0.213691 0.284921 0.338575 0.067530 0.728955 0.120259 0.083256 0.024052 0.914894 0.019426 0.041628 0.011101 0.017576 0.012951 0.958372 0.017576 0.043478 0.036078 0.902868 0.016651 0.016651 0.013876 0.952821 0.067530 0.069380 0.815911 0.047179 0.913043 0.025902 0.023127 0.037928 0.120259 0.025902 0.047179 0.806660 0.124884 0.283071 0.426457 0.165587 0.216466 0.201665 0.128585 0.453284 0.174838 0.276596 0.243293 0.305273 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0768.2 MOTIF MA0768.3 Lef1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1081 E= 0 0.067530 0.728955 0.120259 0.083256 0.024052 0.914894 0.019426 0.041628 0.011101 0.017576 0.012951 0.958372 0.017576 0.043478 0.036078 0.902868 0.016651 0.016651 0.013876 0.952821 0.067530 0.069380 0.815911 0.047179 0.913043 0.025902 0.023127 0.037928 0.120259 0.025902 0.047179 0.806660 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0768.3 MOTIF MA2391.1 Lg3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 999 E= 0 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.094094 0.905906 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.905906 0.000000 0.094094 0.456914 0.000000 0.543086 0.000000 0.094188 0.000000 0.456914 0.448898 0.058116 0.741483 0.142285 0.058116 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA2391.1 MOTIF MA1518.2 Lhx1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 18 nsites= 454 E= 0 0.292952 0.198238 0.288546 0.220264 0.259912 0.215859 0.325991 0.198238 0.224670 0.224670 0.325991 0.224670 0.200441 0.110132 0.176211 0.513216 0.101322 0.127753 0.607930 0.162996 0.083700 0.572687 0.143172 0.200441 0.028634 0.052863 0.013216 0.905286 0.892070 0.066079 0.035242 0.006608 0.962555 0.004405 0.011013 0.022026 0.022026 0.011013 0.002203 0.964758 0.006608 0.035242 0.061674 0.896476 0.907489 0.011013 0.052863 0.028634 0.207048 0.140969 0.572687 0.079295 0.162996 0.607930 0.129956 0.099119 0.513216 0.174009 0.114537 0.198238 0.213656 0.328194 0.233480 0.224670 0.198238 0.330396 0.211454 0.259912 0.224670 0.290749 0.191630 0.292952 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1518.2 MOTIF MA1518.3 Lhx1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 454 E= 0 0.101322 0.127753 0.607930 0.162996 0.083700 0.572687 0.143172 0.200441 0.028634 0.052863 0.013216 0.905286 0.892070 0.066079 0.035242 0.006608 0.962555 0.004405 0.011013 0.022026 0.022026 0.011013 0.002203 0.964758 0.006608 0.035242 0.061674 0.896476 0.907489 0.011013 0.052863 0.028634 0.207048 0.140969 0.572687 0.079295 0.162996 0.607930 0.129956 0.099119 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1518.3 MOTIF MA0135.1 Lhx3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 20 E= 0 0.450000 0.000000 0.150000 0.400000 0.800000 0.100000 0.100000 0.000000 0.950000 0.000000 0.000000 0.050000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.950000 0.000000 0.000000 0.050000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.100000 0.100000 0.000000 0.800000 0.000000 0.050000 0.000000 0.950000 0.800000 0.050000 0.000000 0.150000 0.450000 0.000000 0.150000 0.400000 0.100000 0.400000 0.000000 0.500000 0.100000 0.450000 0.150000 0.300000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0135.1