MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA2683.1 NPAS3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 996 E= 0 0.758032 0.039157 0.182731 0.020080 0.046185 0.846386 0.012048 0.095382 0.037149 0.006024 0.944779 0.012048 0.003012 0.002008 0.000000 0.994980 0.001004 0.000000 0.997992 0.001004 0.340361 0.535141 0.055221 0.069277 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA2683.1 MOTIF MA1531.1 NR1D1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 6996 E= 0 0.462121 0.051172 0.480560 0.006146 0.002181 0.000273 0.898991 0.098555 0.007660 0.000000 0.990538 0.001802 0.000000 0.024384 0.194957 0.780658 0.000000 0.608395 0.000185 0.391421 0.998335 0.000303 0.000303 0.001060 0.094769 0.188173 0.671418 0.045641 0.002880 0.016847 0.030670 0.949604 0.533970 0.013737 0.450650 0.001643 0.000000 0.000000 0.855605 0.144395 0.001210 0.000000 0.997882 0.000908 0.026836 0.054051 0.088195 0.830918 0.000142 0.938256 0.012662 0.048940 0.875133 0.000531 0.121683 0.002654 0.253829 0.232297 0.274299 0.239575 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1531.1 MOTIF MA1531.2 NR1D1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 6996 E= 0 0.462121 0.051172 0.480560 0.006146 0.002181 0.000273 0.898991 0.098555 0.007660 0.000000 0.990538 0.001802 0.000000 0.024384 0.194957 0.780658 0.000000 0.608395 0.000185 0.391421 0.998335 0.000303 0.000303 0.001060 0.094769 0.188173 0.671418 0.045641 0.002880 0.016847 0.030670 0.949604 0.533970 0.013737 0.450650 0.001643 0.000000 0.000000 0.855605 0.144395 0.001210 0.000000 0.997882 0.000908 0.026836 0.054051 0.088195 0.830918 0.000142 0.938256 0.012662 0.048940 0.875133 0.000531 0.121683 0.002654 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1531.2 MOTIF MA1532.1 NR1D2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 1838 E= 0 0.401523 0.065832 0.498912 0.033732 0.016007 0.000445 0.735883 0.247666 0.024460 0.002275 0.941411 0.031854 0.002250 0.041404 0.211521 0.744824 0.014329 0.388771 0.005403 0.591496 0.932394 0.000000 0.016338 0.051268 0.142598 0.180665 0.522659 0.154079 0.033774 0.062653 0.093490 0.810083 0.442452 0.019665 0.514748 0.023135 0.005677 0.000000 0.671127 0.323195 0.023310 0.002331 0.964452 0.009907 0.062271 0.057234 0.122711 0.757784 0.012888 0.666532 0.053967 0.266613 0.713055 0.007755 0.238690 0.040500 0.235650 0.167976 0.276133 0.320242 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1532.1 MOTIF MA1532.2 NR1D2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 65541 E= 0 0.012267 0.028639 0.082834 0.876261 0.483311 0.015215 0.497326 0.004148 0.001035 0.001333 0.923374 0.074258 0.001750 0.000327 0.997318 0.000605 0.000440 0.007550 0.068139 0.923871 0.000425 0.495125 0.000213 0.504237 0.994919 0.000000 0.000033 0.005049 0.060107 0.117712 0.777078 0.045103 0.001081 0.007517 0.015631 0.975771 0.520535 0.005092 0.472900 0.001473 0.000891 0.000354 0.813411 0.185344 0.004263 0.001318 0.993297 0.001123 0.023377 0.035435 0.078309 0.862880 0.000645 0.873381 0.014200 0.111774 0.850589 0.000662 0.140660 0.008090 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1532.2 MOTIF MA0115.1 NR1H2::RXRA letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 25 E= 0 0.680000 0.200000 0.000000 0.120000 0.680000 0.040000 0.200000 0.080000 0.800000 0.000000 0.200000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.960000 0.040000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.960000 0.000000 0.000000 0.040000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.800000 0.040000 0.080000 0.080000 0.000000 0.600000 0.240000 0.160000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0115.1 MOTIF MA1110.1 NR1H4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 505 E= 0 0.150495 0.164356 0.231683 0.453465 0.134653 0.475248 0.172277 0.217822 0.912871 0.019802 0.023762 0.043564 0.817822 0.055446 0.071287 0.055446 0.005941 0.029703 0.011881 0.952475 0.047525 0.013861 0.914851 0.023762 0.900990 0.043564 0.027723 0.027723 0.051485 0.926733 0.000000 0.021782 0.023762 0.942574 0.011881 0.021782 0.142574 0.267327 0.160396 0.429703 0.267327 0.259406 0.207921 0.265347 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1110.1 MOTIF MA1146.1 NR1H4::RXRA letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 1000 E= 0 0.223000 0.172000 0.451000 0.154000 0.653654 0.055055 0.280280 0.011011 0.029000 0.015000 0.937000 0.019000 0.021978 0.008991 0.645355 0.323676 0.024000 0.049000 0.101000 0.826000 0.011011 0.875876 0.013013 0.100100 0.720721 0.013013 0.249249 0.017017 0.144000 0.121000 0.075000 0.660000 0.022977 0.091908 0.047952 0.837163 0.108000 0.102000 0.753000 0.037000 0.762238 0.111888 0.077922 0.047952 0.134134 0.773774 0.009009 0.083083 0.113000 0.798000 0.038000 0.051000 0.025000 0.383000 0.071000 0.521000 0.095000 0.313000 0.212000 0.380000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1146.1 MOTIF MA1146.2 NR1H4::RXRA letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 999 E= 0 0.653654 0.055055 0.280280 0.011011 0.029000 0.015000 0.937000 0.019000 0.021978 0.008991 0.645355 0.323676 0.024000 0.049000 0.101000 0.826000 0.011011 0.875876 0.013013 0.100100 0.720721 0.013013 0.249249 0.017017 0.144000 0.121000 0.075000 0.660000 0.022977 0.091908 0.047952 0.837163 0.108000 0.102000 0.753000 0.037000 0.762238 0.111888 0.077922 0.047952 0.134134 0.773774 0.009009 0.083083 0.113000 0.798000 0.038000 0.051000 0.025000 0.383000 0.071000 0.521000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1146.2 MOTIF MA1533.1 NR1I2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 164 E= 0 0.353659 0.109756 0.335366 0.201220 0.022727 0.340909 0.051136 0.585227 0.051429 0.000000 0.937143 0.011429 0.680498 0.165975 0.099585 0.053942 0.728889 0.271111 0.000000 0.000000 0.017857 0.976190 0.005952 0.000000 0.040230 0.287356 0.017241 0.655172 0.054878 0.524390 0.310976 0.109756 0.310976 0.182927 0.341463 0.164634 0.400000 0.139394 0.242424 0.218182 0.000000 0.282209 0.000000 0.717791 0.107143 0.010204 0.836735 0.045918 0.738739 0.184685 0.054054 0.022523 0.755760 0.235023 0.009217 0.000000 0.000000 0.982036 0.000000 0.017964 0.005917 0.319527 0.029586 0.644970 0.067073 0.506098 0.201220 0.225610 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1533.1