MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA1905.1 Nkx3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1000 E= 0 0.265000 0.210000 0.217000 0.308000 0.261000 0.214000 0.227000 0.298000 0.262262 0.221221 0.240240 0.276276 0.251251 0.237237 0.245245 0.266266 0.249000 0.240000 0.221000 0.290000 0.280000 0.255000 0.226000 0.239000 0.328000 0.209000 0.246000 0.217000 0.080000 0.088000 0.097000 0.735000 0.041000 0.044000 0.023000 0.892000 0.896000 0.031000 0.042000 0.031000 0.913000 0.024000 0.031000 0.032000 0.048000 0.036000 0.042000 0.874000 0.057000 0.051000 0.100000 0.792000 0.380380 0.138138 0.278278 0.203203 0.260000 0.250000 0.265000 0.225000 0.239000 0.240000 0.253000 0.268000 0.259740 0.218781 0.253746 0.267732 0.278000 0.211000 0.242000 0.269000 0.261000 0.211000 0.243000 0.285000 0.269730 0.209790 0.240759 0.279720 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1905.1 MOTIF MA1905.2 Nkx3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 1000 E= 0 0.080000 0.088000 0.097000 0.735000 0.041000 0.044000 0.023000 0.892000 0.896000 0.031000 0.042000 0.031000 0.913000 0.024000 0.031000 0.032000 0.048000 0.036000 0.042000 0.874000 0.057000 0.051000 0.100000 0.792000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1905.2 MOTIF MA0124.2 Nkx3-1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 5334 E= 0 0.457068 0.185789 0.255156 0.101987 0.117246 0.637624 0.212262 0.032867 0.000000 0.939095 0.001760 0.059145 0.976927 0.005127 0.001831 0.016114 0.010902 0.985772 0.001663 0.001663 0.000000 0.000187 0.000000 0.999813 0.000000 0.045446 0.000000 0.954554 0.846288 0.043306 0.027443 0.082963 0.513821 0.135510 0.205336 0.145334 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0124.2 MOTIF MA0124.3 Nkx3-1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 8367 E= 0 0.117246 0.637624 0.212262 0.032867 0.000000 0.939095 0.001760 0.059145 0.976927 0.005127 0.001831 0.016114 0.010902 0.985772 0.001663 0.001663 0.000000 0.000187 0.000000 0.999813 0.000000 0.045446 0.000000 0.954554 0.846288 0.043306 0.027443 0.082963 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0124.3 MOTIF MA0122.1 Nkx3-2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 24 E= 0 0.166667 0.291667 0.166667 0.375000 0.041667 0.166667 0.208333 0.583333 0.541667 0.041667 0.291667 0.125000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.250000 0.000000 0.750000 0.000000 0.166667 0.250000 0.500000 0.083333 0.375000 0.291667 0.208333 0.125000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0122.1 MOTIF MA0122.3 Nkx3-2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 10220 E= 0 0.380333 0.144227 0.169863 0.305577 0.334736 0.157926 0.168982 0.338356 0.559100 0.093151 0.143444 0.204305 0.547750 0.108513 0.112916 0.230822 0.254795 0.496967 0.147162 0.101076 0.007730 0.968689 0.002250 0.021331 0.969374 0.008023 0.001859 0.020744 0.014775 0.975049 0.000978 0.009198 0.004892 0.003131 0.002838 0.989139 0.009295 0.013503 0.006654 0.970548 0.947162 0.014384 0.006654 0.031800 0.549902 0.096967 0.133855 0.219276 0.332387 0.203816 0.181018 0.282779 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0122.3 MOTIF MA0122.4 Nkx3-2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 10220 E= 0 0.559100 0.093151 0.143444 0.204305 0.547750 0.108513 0.112916 0.230822 0.254795 0.496967 0.147162 0.101076 0.007730 0.968689 0.002250 0.021331 0.969374 0.008023 0.001859 0.020744 0.014775 0.975049 0.000978 0.009198 0.004892 0.003131 0.002838 0.989139 0.009295 0.013503 0.006654 0.970548 0.947162 0.014384 0.006654 0.031800 0.549902 0.096967 0.133855 0.219276 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0122.4 MOTIF MA0125.1 Nobox letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 38 E= 0 0.000000 0.026316 0.000000 0.973684 0.947368 0.000000 0.000000 0.052632 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.026316 0.026316 0.052632 0.894737 0.052632 0.000000 0.105263 0.842105 0.394737 0.000000 0.578947 0.026316 0.105263 0.315789 0.473684 0.105263 0.052632 0.342105 0.157895 0.447368 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0125.1 MOTIF MA0125.2 Nobox letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 38 E= 0 0.000000 0.026316 0.000000 0.973684 0.947368 0.000000 0.000000 0.052632 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.026316 0.026316 0.052632 0.894737 0.052632 0.000000 0.105263 0.842105 0.394737 0.000000 0.578947 0.026316 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0125.2 MOTIF MA1906.1 Noto letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1000 E= 0 0.283000 0.201000 0.228000 0.288000 0.271000 0.209000 0.238000 0.282000 0.262262 0.223223 0.246246 0.268268 0.262737 0.232767 0.241758 0.262737 0.264000 0.244000 0.242000 0.250000 0.281000 0.246000 0.259000 0.214000 0.248000 0.253000 0.200000 0.299000 0.045954 0.032967 0.019980 0.901099 0.890891 0.026026 0.044044 0.039039 0.950000 0.009000 0.018000 0.023000 0.011000 0.017000 0.011000 0.961000 0.085000 0.060000 0.634000 0.221000 0.817000 0.049000 0.082000 0.052000 0.205794 0.227772 0.294705 0.271728 0.213786 0.260739 0.263736 0.261738 0.255000 0.248000 0.230000 0.267000 0.253000 0.228000 0.219000 0.300000 0.274000 0.220000 0.213000 0.293000 0.292000 0.210000 0.203000 0.295000 0.295000 0.206000 0.199000 0.300000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1906.1