MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0494.1 Nr1h3::Rxra letter-probability matrix: alength= 4 w= 19 nsites= 1269 E= 0 0.000000 0.039401 0.022065 0.938534 0.110323 0.023641 0.858156 0.007880 0.581560 0.191489 0.107959 0.118991 0.193853 0.765169 0.000000 0.040977 0.045705 0.851064 0.002364 0.100867 0.061466 0.246651 0.100867 0.591017 0.282112 0.250591 0.270292 0.197006 0.294720 0.202522 0.264775 0.237983 0.625690 0.000000 0.252955 0.121355 0.219070 0.014972 0.711584 0.054374 0.060678 0.000000 0.003152 0.936170 0.440504 0.060678 0.346730 0.152088 0.709220 0.139480 0.151300 0.000000 0.200946 0.758077 0.015760 0.025217 0.092199 0.819543 0.000000 0.088258 0.008668 0.395587 0.033097 0.562648 0.106383 0.400315 0.154452 0.338849 0.221434 0.154452 0.262411 0.361702 0.186761 0.228526 0.345942 0.238771 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0494.1 MOTIF MA0494.2 Nr1h3::Rxra letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 1269 E= 0 0.000000 0.039401 0.022065 0.938534 0.110323 0.023641 0.858156 0.007880 0.581560 0.191489 0.107959 0.118991 0.193853 0.765169 0.000000 0.040977 0.045705 0.851064 0.002364 0.100867 0.061466 0.246651 0.100867 0.591017 0.282112 0.250591 0.270292 0.197006 0.294720 0.202522 0.264775 0.237983 0.625690 0.000000 0.252955 0.121355 0.219070 0.014972 0.711584 0.054374 0.060678 0.000000 0.003152 0.936170 0.440504 0.060678 0.346730 0.152088 0.709220 0.139480 0.151300 0.000000 0.200946 0.758077 0.015760 0.025217 0.092199 0.819543 0.000000 0.088258 0.008668 0.395587 0.033097 0.562648 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0494.2 MOTIF MA0728.1 Nr2F6 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 288 E= 0 0.347222 0.055556 0.597222 0.000000 0.825545 0.000000 0.165109 0.009346 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.005435 0.000000 0.994565 0.000000 0.000000 0.000000 0.002639 0.997361 0.000000 0.927677 0.001391 0.070932 0.940952 0.057143 0.000000 0.001905 0.953052 0.009390 0.016432 0.021127 0.518868 0.000000 0.295597 0.185535 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.968750 0.031250 0.005391 0.000000 0.000000 0.994609 0.000000 0.995595 0.000000 0.004405 0.980220 0.000000 0.019780 0.000000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0728.1 MOTIF MA0676.1 Nr2e1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 1954 E= 0 0.572160 0.124872 0.097748 0.205220 0.552372 0.043972 0.221344 0.182312 0.902341 0.000807 0.081517 0.015335 0.934002 0.000000 0.061821 0.004177 0.034305 0.000000 0.958834 0.006861 0.000000 0.049320 0.000000 0.950680 0.008779 0.892259 0.009577 0.089385 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.693118 0.081215 0.072536 0.153131 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0676.1 MOTIF MA0164.1 Nr2e3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 23 E= 0 0.173913 0.521739 0.086957 0.217391 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.043478 0.956522 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0164.1 MOTIF MA0164.2 Nr2e3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 23 E= 0 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.043478 0.956522 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0164.2 MOTIF MA0677.1 Nr2f6 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 438 E= 0 0.347032 0.155251 0.372146 0.125571 0.552430 0.028133 0.404092 0.015345 0.028571 0.020000 0.891429 0.060000 0.031609 0.022989 0.876437 0.068966 0.013825 0.041475 0.057604 0.887097 0.018092 0.860197 0.029605 0.092105 0.953782 0.012605 0.016807 0.016807 0.828460 0.021442 0.081871 0.068226 0.924025 0.004107 0.071869 0.000000 0.006079 0.006079 0.972644 0.015198 0.011940 0.002985 0.937313 0.047761 0.004484 0.022422 0.033632 0.939462 0.001439 0.883453 0.030216 0.084892 0.885602 0.013807 0.086785 0.013807 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0677.1 MOTIF MA0677.2 Nr2f6 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 391 E= 0 0.552430 0.028133 0.404092 0.015345 0.028571 0.020000 0.891429 0.060000 0.031609 0.022989 0.876437 0.068966 0.013825 0.041475 0.057604 0.887097 0.018092 0.860197 0.029605 0.092105 0.953782 0.012605 0.016807 0.016807 0.828460 0.021442 0.081871 0.068226 0.924025 0.004107 0.071869 0.000000 0.006079 0.006079 0.972644 0.015198 0.011940 0.002985 0.937313 0.047761 0.004484 0.022422 0.033632 0.939462 0.001439 0.883453 0.030216 0.084892 0.885602 0.013807 0.086785 0.013807 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0677.2 MOTIF MA0505.2 Nr5A2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 30542 E= 0 0.259184 0.297165 0.255255 0.188396 0.131622 0.102089 0.075404 0.690885 0.066531 0.028453 0.889202 0.015814 0.651169 0.038799 0.220549 0.089483 0.010707 0.977474 0.004060 0.007760 0.009790 0.973545 0.005435 0.011230 0.011918 0.022723 0.011754 0.953605 0.008709 0.011067 0.009331 0.970893 0.011132 0.028485 0.949840 0.010543 0.863401 0.021118 0.078646 0.036835 0.448759 0.293301 0.173270 0.084670 0.175103 0.480355 0.137221 0.207321 0.172418 0.195239 0.142099 0.490243 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0505.2 MOTIF MA1540.3 Nr5a1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 4697 E= 0 0.626996 0.084735 0.134767 0.153502 0.150735 0.118799 0.601448 0.129019 0.080051 0.159038 0.155205 0.605706 0.034064 0.120077 0.027677 0.818182 0.015329 0.918884 0.040238 0.025548 0.912710 0.041090 0.026613 0.019587 0.923994 0.018310 0.034064 0.023632 0.022568 0.009581 0.949755 0.018097 0.018522 0.011284 0.945284 0.024910 0.082819 0.205237 0.036406 0.675538 0.014264 0.909304 0.023845 0.052587 0.894401 0.030658 0.032787 0.042155 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1540.3