MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0069.1 PAX6 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 43 E= 0 0.046512 0.093023 0.093023 0.767442 0.046512 0.046512 0.000000 0.906977 0.093023 0.604651 0.023256 0.279070 0.906977 0.046512 0.023256 0.023256 0.069767 0.790698 0.023256 0.116279 0.023256 0.000000 0.953488 0.023256 0.023256 0.860465 0.093023 0.023256 0.488372 0.046512 0.046512 0.418605 0.023256 0.093023 0.023256 0.860465 0.046512 0.325581 0.581395 0.046512 0.837209 0.000000 0.139535 0.023256 0.255814 0.255814 0.302326 0.186047 0.023256 0.116279 0.069767 0.790698 0.023256 0.000000 0.395349 0.581395 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0069.1 MOTIF MA0680.1 PAX7 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 4553 E= 0 0.149132 0.014935 0.021524 0.814408 0.989328 0.004803 0.004269 0.001601 0.999192 0.000808 0.000000 0.000000 0.001605 0.005618 0.000803 0.991974 0.002672 0.784073 0.006414 0.206841 0.303882 0.007229 0.688889 0.000000 0.994635 0.000000 0.002682 0.002682 0.003226 0.000000 0.000000 0.996774 0.005581 0.006644 0.002392 0.985384 0.909715 0.017664 0.011531 0.061089 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0680.1 MOTIF MA2094.1 PAX8 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 9248 E= 0 0.072881 0.621648 0.220480 0.084991 0.004935 0.002167 0.937410 0.055489 0.090061 0.118053 0.002028 0.789858 0.004210 0.819703 0.003263 0.172824 0.967694 0.002112 0.018390 0.011804 0.001870 0.856577 0.000440 0.141113 0.019613 0.001257 0.979130 0.000000 0.000875 0.756925 0.242006 0.000194 0.421564 0.105769 0.052831 0.419836 0.012202 0.293997 0.000178 0.693623 0.001914 0.415082 0.578538 0.004466 0.675631 0.003730 0.319250 0.001388 0.190959 0.358418 0.261205 0.189418 0.046413 0.344068 0.031494 0.578025 0.269197 0.004701 0.678043 0.048059 0.291859 0.482537 0.218413 0.007191 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA2094.1 MOTIF MA0781.1 PAX9 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 3984 E= 0 0.038655 0.604920 0.295181 0.061245 0.000000 0.000000 0.997383 0.002617 0.020983 0.004071 0.001879 0.973066 0.000000 0.956665 0.000000 0.043335 0.977677 0.021418 0.000603 0.000302 0.000000 0.935304 0.000000 0.064696 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.835595 0.164405 0.000000 0.597985 0.026974 0.004225 0.370816 0.000307 0.020878 0.000000 0.978815 0.000604 0.284105 0.714688 0.000604 0.868206 0.000000 0.131794 0.000000 0.180238 0.412344 0.278760 0.128658 0.001794 0.061883 0.000000 0.936323 0.035420 0.001996 0.899975 0.062609 0.303893 0.581509 0.114599 0.000000 0.435580 0.266055 0.128440 0.169924 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0781.1 MOTIF MA0781.2 PAX9 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 3984 E= 0 0.038655 0.604920 0.295181 0.061245 0.000000 0.000000 0.997383 0.002617 0.020983 0.004071 0.001879 0.973066 0.000000 0.956665 0.000000 0.043335 0.977677 0.021418 0.000603 0.000302 0.000000 0.935304 0.000000 0.064696 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.835595 0.164405 0.000000 0.597985 0.026974 0.004225 0.370816 0.000307 0.020878 0.000000 0.978815 0.000604 0.284105 0.714688 0.000604 0.868206 0.000000 0.131794 0.000000 0.180238 0.412344 0.278760 0.128658 0.001794 0.061883 0.000000 0.936323 0.035420 0.001996 0.899975 0.062609 0.303893 0.581509 0.114599 0.000000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0781.2 MOTIF MA0064.1 PBF letter-probability matrix: alength= 4 w= 5 nsites= 16 E= 0 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.062500 0.562500 0.062500 0.312500 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0064.1 MOTIF MA0070.1 PBX1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 18 E= 0 0.277778 0.333333 0.111111 0.277778 0.166667 0.500000 0.166667 0.166667 0.888889 0.055556 0.055556 0.000000 0.055556 0.055556 0.000000 0.888889 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.944444 0.055556 0.000000 0.000000 0.944444 0.000000 0.000000 0.055556 0.000000 0.000000 0.055556 0.944444 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.888889 0.055556 0.000000 0.055556 0.666667 0.000000 0.055556 0.277778 0.444444 0.111111 0.111111 0.333333 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0070.1 MOTIF MA0070.2 PBX1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 18 E= 0 0.888889 0.055556 0.055556 0.000000 0.055556 0.055556 0.000000 0.888889 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.944444 0.055556 0.000000 0.000000 0.944444 0.000000 0.000000 0.055556 0.000000 0.000000 0.055556 0.944444 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.888889 0.055556 0.000000 0.055556 0.666667 0.000000 0.055556 0.277778 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0070.2 MOTIF MA1113.1 PBX2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 2495 E= 0 0.243287 0.242084 0.283768 0.230862 0.179960 0.070541 0.106613 0.642886 0.076553 0.066533 0.760321 0.096593 0.953507 0.011623 0.018437 0.016433 0.054108 0.123848 0.203206 0.618838 0.022846 0.008818 0.046894 0.921443 0.012826 0.017635 0.941884 0.027655 0.898597 0.008417 0.080160 0.012826 0.007615 0.969539 0.010020 0.012826 0.919038 0.010020 0.036874 0.034068 0.105010 0.159920 0.583567 0.151503 0.205210 0.302204 0.317836 0.174749 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1113.1 MOTIF MA1113.2 PBX2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 29596 E= 0 0.282572 0.198101 0.325213 0.194114 0.280680 0.299331 0.102953 0.317036 0.166408 0.663772 0.053555 0.116266 0.899446 0.021253 0.057778 0.021523 0.007602 0.019868 0.010711 0.961819 0.823355 0.076564 0.027605 0.072476 0.920564 0.019395 0.011589 0.048452 0.921037 0.025476 0.019226 0.034261 0.023787 0.015306 0.011049 0.949858 0.077646 0.807339 0.018753 0.096263 0.876639 0.028653 0.011893 0.082815 0.236282 0.238444 0.133532 0.391742 0.266827 0.239424 0.188336 0.305413 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1113.2