MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0782.2 PKNOX1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 39963 E= 0 0.245502 0.237795 0.240197 0.276506 0.256362 0.245927 0.238596 0.259115 0.130671 0.040663 0.083127 0.745540 0.041388 0.029027 0.903486 0.026099 0.919826 0.016966 0.033281 0.029928 0.058179 0.103170 0.655156 0.183495 0.028526 0.021970 0.025699 0.923805 0.013888 0.025123 0.943698 0.017291 0.910192 0.010259 0.061532 0.018017 0.016290 0.947026 0.014513 0.022171 0.850337 0.023622 0.060256 0.065786 0.068689 0.119085 0.684808 0.127418 0.211496 0.408903 0.228411 0.151190 0.215624 0.234867 0.226710 0.322799 0.263294 0.231915 0.257638 0.247154 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0782.2 MOTIF MA0782.3 PKNOX1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 39963 E= 0 0.130671 0.040663 0.083127 0.745540 0.041388 0.029027 0.903486 0.026099 0.919826 0.016966 0.033281 0.029928 0.058179 0.103170 0.655156 0.183495 0.028526 0.021970 0.025699 0.923805 0.013888 0.025123 0.943698 0.017291 0.910192 0.010259 0.061532 0.018017 0.016290 0.947026 0.014513 0.022171 0.850337 0.023622 0.060256 0.065786 0.068689 0.119085 0.684808 0.127418 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0782.3 MOTIF MA0783.1 PKNOX2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 1238 E= 0 0.029887 0.000000 0.007270 0.962843 0.000716 0.004298 0.994986 0.000000 0.980803 0.002618 0.011344 0.005236 0.000000 0.992851 0.000000 0.007149 0.995741 0.000000 0.000852 0.003407 0.004919 0.000000 0.912157 0.082923 0.037321 0.290909 0.671770 0.000000 0.000000 0.003311 0.000000 0.996689 0.002183 0.000728 0.997089 0.000000 0.008258 0.023947 0.004129 0.963666 0.008560 0.984436 0.004669 0.002335 0.974611 0.000819 0.017199 0.007371 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0783.1 MOTIF MA0163.1 PLAG1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 18 E= 0 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.166667 0.000000 0.777778 0.055556 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.944444 0.055556 0.000000 0.777778 0.222222 0.000000 0.000000 0.833333 0.055556 0.111111 0.222222 0.555556 0.055556 0.166667 0.666667 0.000000 0.000000 0.333333 0.611111 0.277778 0.111111 0.000000 0.111111 0.000000 0.777778 0.111111 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.888889 0.111111 0.111111 0.000000 0.888889 0.000000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0163.1 MOTIF MA1548.1 PLAGL2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 999 E= 0 0.224224 0.224224 0.224224 0.327327 0.039078 0.039078 0.814629 0.107214 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.151151 0.848849 0.000000 0.000000 0.799800 0.200200 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.925926 0.000000 0.074074 0.090271 0.686058 0.025075 0.198596 0.210210 0.210210 0.210210 0.369369 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1548.1 MOTIF MA1548.2 PLAGL2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 998 E= 0 0.039078 0.039078 0.814629 0.107214 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.151151 0.848849 0.000000 0.000000 0.799800 0.200200 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.925926 0.000000 0.074074 0.090271 0.686058 0.025075 0.198596 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1548.2 MOTIF MA1377.1 PLT1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 19 nsites= 195 E= 0 0.153846 0.066667 0.497436 0.282051 0.215385 0.025641 0.569231 0.189744 0.015385 0.876923 0.000000 0.107692 0.748718 0.046154 0.123077 0.082051 0.010256 0.958974 0.015385 0.015385 0.148718 0.020513 0.800000 0.030769 0.302564 0.210256 0.328205 0.158974 0.471795 0.046154 0.082051 0.400000 0.189744 0.102564 0.025641 0.682051 0.220513 0.420513 0.000000 0.358974 0.066667 0.528205 0.005128 0.400000 0.000000 0.989744 0.000000 0.010256 0.241026 0.046154 0.646154 0.066667 0.969231 0.000000 0.030769 0.000000 0.082051 0.046154 0.728205 0.143590 0.389744 0.015385 0.584615 0.010256 0.410256 0.317949 0.051282 0.220513 0.410256 0.143590 0.251282 0.194872 0.369231 0.169231 0.276923 0.184615 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1377.1 MOTIF MA1377.2 PLT1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 195 E= 0 0.153846 0.066667 0.497436 0.282051 0.215385 0.025641 0.569231 0.189744 0.015385 0.876923 0.000000 0.107692 0.748718 0.046154 0.123077 0.082051 0.010256 0.958974 0.015385 0.015385 0.148718 0.020513 0.800000 0.030769 0.302564 0.210256 0.328205 0.158974 0.471795 0.046154 0.082051 0.400000 0.189744 0.102564 0.025641 0.682051 0.220513 0.420513 0.000000 0.358974 0.066667 0.528205 0.005128 0.400000 0.000000 0.989744 0.000000 0.010256 0.241026 0.046154 0.646154 0.066667 0.969231 0.000000 0.030769 0.000000 0.082051 0.046154 0.728205 0.143590 0.389744 0.015385 0.584615 0.010256 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1377.2 MOTIF UN0276.1 PNRC2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 998 E= 0 0.726453 0.182365 0.091182 0.000000 0.874749 0.000000 0.000000 0.125251 0.687375 0.000000 0.000000 0.312625 0.312625 0.687375 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.937813 0.000000 0.062187 0.062187 0.000000 0.000000 0.937813 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/UN0276.1 MOTIF MA2560.1 POGK letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 1000 E= 0 0.000000 0.994000 0.000000 0.006000 0.010000 0.000000 0.990000 0.000000 0.603000 0.370000 0.005000 0.022000 0.728000 0.005000 0.163000 0.104000 0.005000 0.001000 0.002000 0.992000 0.997000 0.000000 0.003000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.736000 0.000000 0.264000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.999000 0.001000 0.989000 0.000000 0.009000 0.002000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA2560.1