MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA2114.1 Pax3-7-like letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 1000 E= 0 0.915000 0.023000 0.026000 0.036000 0.048000 0.040000 0.029000 0.883000 0.031000 0.118000 0.057000 0.794000 0.146000 0.053000 0.749000 0.052000 0.876000 0.032000 0.049000 0.043000 0.028971 0.020979 0.020979 0.929071 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA2114.1 MOTIF MA0068.1 Pax4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 21 E= 0 0.333333 0.095238 0.523810 0.047619 0.952381 0.000000 0.047619 0.000000 0.761905 0.095238 0.047619 0.095238 0.523810 0.047619 0.047619 0.380952 0.619048 0.047619 0.142857 0.190476 0.523810 0.142857 0.047619 0.285714 0.285714 0.047619 0.095238 0.571429 0.428571 0.047619 0.047619 0.476190 0.238095 0.142857 0.285714 0.333333 0.238095 0.523810 0.047619 0.190476 0.285714 0.523810 0.190476 0.000000 0.333333 0.333333 0.238095 0.095238 0.380952 0.333333 0.095238 0.190476 0.285714 0.238095 0.047619 0.428571 0.476190 0.238095 0.190476 0.095238 0.190476 0.380952 0.190476 0.238095 0.142857 0.285714 0.190476 0.380952 0.333333 0.380952 0.142857 0.142857 0.190476 0.428571 0.142857 0.238095 0.428571 0.285714 0.095238 0.190476 0.238095 0.333333 0.238095 0.190476 0.238095 0.285714 0.095238 0.380952 0.333333 0.523810 0.000000 0.142857 0.285714 0.428571 0.047619 0.238095 0.142857 0.571429 0.095238 0.190476 0.333333 0.428571 0.095238 0.142857 0.142857 0.571429 0.095238 0.190476 0.047619 0.523810 0.142857 0.285714 0.285714 0.523810 0.047619 0.142857 0.142857 0.619048 0.095238 0.142857 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0068.1 MOTIF MA0014.1 Pax5 letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 12 E= 0 0.333333 0.083333 0.333333 0.250000 0.333333 0.000000 0.666667 0.000000 0.333333 0.250000 0.250000 0.166667 0.083333 0.166667 0.416667 0.333333 0.166667 0.583333 0.083333 0.166667 0.583333 0.166667 0.083333 0.166667 0.166667 0.416667 0.250000 0.166667 0.000000 0.250000 0.166667 0.583333 0.083333 0.166667 0.666667 0.083333 0.500000 0.083333 0.250000 0.166667 0.500000 0.000000 0.166667 0.333333 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.166667 0.666667 0.083333 0.083333 0.250000 0.000000 0.750000 0.000000 0.083333 0.000000 0.333333 0.583333 0.500000 0.083333 0.416667 0.000000 0.416667 0.083333 0.416667 0.083333 0.166667 0.833333 0.000000 0.000000 0.166667 0.416667 0.416667 0.000000 0.416667 0.000000 0.500000 0.083333 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0014.1 MOTIF MA2115.1 Pax6 letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 1001 E= 0 0.069930 0.107892 0.081918 0.740260 0.033000 0.057000 0.026000 0.884000 0.872128 0.050949 0.056943 0.019980 0.923000 0.023000 0.030000 0.024000 0.048000 0.027000 0.029000 0.896000 0.035000 0.066000 0.088000 0.811000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA2115.1 MOTIF MA0680.2 Pax7 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 41429 E= 0 0.354776 0.165005 0.219556 0.260663 0.286756 0.178160 0.158585 0.376500 0.225977 0.085013 0.076010 0.613001 0.932149 0.020710 0.021820 0.025320 0.941611 0.016269 0.017355 0.024765 0.021048 0.026358 0.020058 0.932535 0.027807 0.750416 0.032731 0.189046 0.853364 0.041541 0.088754 0.016341 0.938521 0.013083 0.026431 0.021965 0.026214 0.010379 0.011924 0.951483 0.026745 0.043569 0.017089 0.912597 0.775809 0.037438 0.038910 0.147843 0.335731 0.128799 0.150643 0.384827 0.252625 0.229284 0.175746 0.342345 0.291100 0.201888 0.162085 0.344927 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0680.2 MOTIF MA0680.3 Pax7 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 41429 E= 0 0.225977 0.085013 0.076010 0.613001 0.932149 0.020710 0.021820 0.025320 0.941611 0.016269 0.017355 0.024765 0.021048 0.026358 0.020058 0.932535 0.027807 0.750416 0.032731 0.189046 0.853364 0.041541 0.088754 0.016341 0.938521 0.013083 0.026431 0.021965 0.026214 0.010379 0.011924 0.951483 0.026745 0.043569 0.017089 0.912597 0.775809 0.037438 0.038910 0.147843 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0680.3 MOTIF MA1702.1 Pdp1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 4816 E= 0 0.304817 0.157600 0.236919 0.300664 0.383721 0.158846 0.282807 0.174626 0.026163 0.009551 0.013289 0.950997 0.022841 0.010174 0.024709 0.942276 0.927741 0.007267 0.045266 0.019726 0.022633 0.070598 0.015365 0.891404 0.068729 0.015781 0.876453 0.039037 0.031977 0.681478 0.016404 0.270141 0.954734 0.018272 0.014743 0.012251 0.956395 0.012458 0.014120 0.017027 0.189784 0.262251 0.144103 0.403862 0.292151 0.245640 0.166528 0.295681 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1702.1 MOTIF MA1702.2 Pdp1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 4816 E= 0 0.026163 0.009551 0.013289 0.950997 0.022841 0.010174 0.024709 0.942276 0.927741 0.007267 0.045266 0.019726 0.022633 0.070598 0.015365 0.891404 0.068729 0.015781 0.876453 0.039037 0.031977 0.681478 0.016404 0.270141 0.954734 0.018272 0.014743 0.012251 0.956395 0.012458 0.014120 0.017027 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1702.2 MOTIF MA0132.1 Pdx1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 31 E= 0 0.032258 0.612903 0.161290 0.193548 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.032258 0.967742 0.032258 0.032258 0.322581 0.612903 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0132.1 MOTIF MA2323.1 Pgr letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 493 E= 0 0.551724 0.172414 0.148073 0.127789 0.742394 0.014199 0.200811 0.042596 0.066937 0.028398 0.876268 0.028398 0.677485 0.083164 0.123732 0.115619 0.918864 0.024341 0.024341 0.032454 0.022312 0.888438 0.052738 0.036511 0.868154 0.034483 0.042596 0.054767 0.501014 0.156187 0.176471 0.166329 0.578093 0.123732 0.123732 0.174442 0.273834 0.190669 0.194726 0.340771 0.066937 0.048682 0.034483 0.849899 0.040568 0.042596 0.900609 0.016227 0.028398 0.040568 0.022312 0.908722 0.117647 0.152130 0.070994 0.659229 0.024341 0.892495 0.014199 0.068966 0.058824 0.168357 0.022312 0.750507 0.117647 0.135903 0.198783 0.547667 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA2323.1