MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0681.1 Phox2b letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 29284 E= 0 0.123071 0.058394 0.020865 0.797671 0.851400 0.009841 0.096807 0.041952 0.996077 0.001066 0.002686 0.000171 0.050523 0.262326 0.025629 0.661522 0.032161 0.369132 0.181181 0.417525 0.109420 0.362824 0.075030 0.452727 0.796665 0.037857 0.144879 0.020600 0.970501 0.008891 0.016370 0.004238 0.000000 0.000385 0.000000 0.999615 0.058112 0.043373 0.001919 0.896595 0.847108 0.007325 0.039964 0.105603 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0681.1 MOTIF UN0304.1 Phyra84400 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 998 E= 0 0.145291 0.528056 0.107214 0.219439 0.172345 0.109218 0.653307 0.065130 0.179539 0.557673 0.038114 0.224674 0.041082 0.924850 0.013026 0.021042 0.127127 0.027027 0.510511 0.335335 0.049147 0.232698 0.059178 0.658977 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.020060 0.002006 0.901705 0.076229 0.039078 0.053106 0.835671 0.072144 0.683367 0.189379 0.076152 0.051102 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/UN0304.1 MOTIF UN0304.2 Phyra84400 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 998 E= 0 0.172345 0.109218 0.653307 0.065130 0.179539 0.557673 0.038114 0.224674 0.041082 0.924850 0.013026 0.021042 0.127127 0.027027 0.510511 0.335335 0.049147 0.232698 0.059178 0.658977 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.020060 0.002006 0.901705 0.076229 0.039078 0.053106 0.835671 0.072144 0.683367 0.189379 0.076152 0.051102 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/UN0304.2 MOTIF MA0682.1 Pitx1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 3115 E= 0 0.192616 0.270305 0.108507 0.428571 0.049076 0.006968 0.000000 0.943956 0.882720 0.043909 0.059490 0.013881 0.994574 0.000000 0.000000 0.005426 0.018858 0.015894 0.125808 0.839440 0.061411 0.861964 0.011618 0.065007 0.040695 0.773201 0.034243 0.151861 0.228177 0.409178 0.137997 0.224647 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0682.1 MOTIF UN0465.1 Pknox letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1000 E= 0 0.275000 0.239000 0.261000 0.225000 0.276000 0.235000 0.281000 0.208000 0.281718 0.253746 0.246753 0.217782 0.262262 0.268268 0.232232 0.237237 0.293000 0.223000 0.278000 0.206000 0.268000 0.221000 0.257000 0.254000 0.227227 0.256256 0.245245 0.271271 0.047000 0.037000 0.035000 0.881000 0.008000 0.016000 0.969000 0.007000 0.827828 0.015015 0.034034 0.123123 0.008000 0.974000 0.004000 0.014000 0.916084 0.005994 0.043956 0.033966 0.083916 0.121878 0.676324 0.117882 0.231000 0.294000 0.267000 0.208000 0.154000 0.281000 0.176000 0.389000 0.227227 0.180180 0.344344 0.248248 0.183000 0.230000 0.254000 0.333000 0.209000 0.349000 0.211000 0.231000 0.279720 0.275724 0.210789 0.233766 0.272727 0.253746 0.247752 0.225774 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/UN0465.1 MOTIF UN0465.2 Pknox letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 1000 E= 0 0.047000 0.037000 0.035000 0.881000 0.008000 0.016000 0.969000 0.007000 0.827828 0.015015 0.034034 0.123123 0.008000 0.974000 0.004000 0.014000 0.916084 0.005994 0.043956 0.033966 0.083916 0.121878 0.676324 0.117882 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/UN0465.2 MOTIF MA1615.1 Plagl1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 14153 E= 0 0.196425 0.319014 0.300996 0.183565 0.204056 0.310959 0.284745 0.200240 0.151063 0.516428 0.213806 0.118703 0.135590 0.103936 0.094538 0.665937 0.013919 0.017170 0.960574 0.008337 0.085706 0.025154 0.866318 0.022822 0.013213 0.018795 0.955063 0.012930 0.012718 0.023741 0.953508 0.010033 0.055253 0.899951 0.022115 0.022681 0.012789 0.929273 0.029817 0.028121 0.852399 0.048470 0.072917 0.026214 0.147884 0.326291 0.342825 0.183000 0.241221 0.255352 0.322688 0.180739 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1615.1 MOTIF MA1615.2 Plagl1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 14153 E= 0 0.135590 0.103936 0.094538 0.665937 0.013919 0.017170 0.960574 0.008337 0.085706 0.025154 0.866318 0.022822 0.013213 0.018795 0.955063 0.012930 0.012718 0.023741 0.953508 0.010033 0.055253 0.899951 0.022115 0.022681 0.012789 0.929273 0.029817 0.028121 0.852399 0.048470 0.072917 0.026214 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1615.2 MOTIF MA0627.1 Pou2f3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.160000 0.200000 0.200000 0.440000 0.240000 0.220000 0.150000 0.390000 0.190000 0.130000 0.400000 0.280000 0.090000 0.120000 0.040000 0.750000 0.990000 0.000000 0.000000 0.010000 0.000000 0.010101 0.000000 0.989899 0.000000 0.000000 0.940000 0.060000 0.000000 0.919192 0.000000 0.080808 0.740000 0.000000 0.000000 0.260000 0.910000 0.000000 0.010000 0.080000 0.990000 0.000000 0.000000 0.010000 0.020000 0.000000 0.020000 0.960000 0.150000 0.160000 0.290000 0.400000 0.460000 0.240000 0.110000 0.190000 0.292929 0.161616 0.353535 0.191919 0.414141 0.242424 0.181818 0.161616 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0627.1 MOTIF MA2116.1 Pou4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 1001 E= 0 0.878122 0.037962 0.030969 0.052947 0.031000 0.016000 0.009000 0.944000 0.685686 0.053053 0.093093 0.168168 0.881000 0.054000 0.020000 0.045000 0.843157 0.019980 0.022977 0.113886 0.045000 0.026000 0.016000 0.913000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA2116.1