MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0142.1 Pou5f1::Sox2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 1364 E= 0 0.046188 0.620235 0.048387 0.285191 0.423865 0.042460 0.020498 0.513177 0.008047 0.036576 0.026335 0.929042 0.034332 0.008766 0.057706 0.899196 0.086194 0.265157 0.602630 0.046019 0.303141 0.013148 0.021183 0.662527 0.150475 0.266618 0.135866 0.447042 0.902118 0.021914 0.017531 0.058437 0.012418 0.003652 0.010957 0.972973 0.007305 0.011687 0.905040 0.075968 0.010234 0.752193 0.094298 0.143275 0.769231 0.011722 0.021978 0.197070 0.651248 0.049927 0.231278 0.067548 0.881705 0.024247 0.055107 0.038942 0.145481 0.087436 0.152094 0.614989 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0142.1 MOTIF MA2263.1 Poxm letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 1000 E= 0 0.142857 0.809524 0.000000 0.047619 0.929204 0.008850 0.061947 0.000000 0.152381 0.333333 0.419048 0.095238 0.000000 0.054054 0.000000 0.945946 0.000000 0.897436 0.102564 0.000000 0.981308 0.000000 0.018692 0.000000 0.389535 0.000000 0.000000 0.610465 0.000000 0.027778 0.972222 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.053097 0.008850 0.929204 0.008850 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.070175 0.000000 0.921053 0.008772 0.963303 0.036697 0.000000 0.000000 0.035000 0.963667 0.000333 0.001000 0.287731 0.114007 0.557003 0.041260 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA2263.1 MOTIF UN0783.1 Poxn letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 999 E= 0 0.563790 0.038240 0.318782 0.079188 0.000000 0.408122 0.591878 0.000000 0.000000 0.979357 0.000000 0.020643 0.020981 0.000000 0.979019 0.000000 0.000000 0.000000 0.086971 0.913029 0.175635 0.000000 0.824365 0.000000 0.946870 0.000000 0.008460 0.044670 0.059880 0.937817 0.000461 0.001842 0.076851 0.082006 0.806935 0.034208 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/UN0783.1 MOTIF MA2394.1 PpDof6 letter-probability matrix: alength= 4 w= 4 nsites= 998 E= 0 0.052104 0.860721 0.027054 0.060120 0.086172 0.053106 0.216433 0.644289 0.081162 0.000000 0.062124 0.856713 0.080241 0.023069 0.067202 0.829488 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA2394.1 MOTIF MA2338.1 Ppara letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 18178 E= 0 0.896633 0.014193 0.043349 0.045825 0.935691 0.035262 0.018044 0.011002 0.014193 0.024535 0.936517 0.024755 0.019474 0.003741 0.957861 0.018924 0.014248 0.004566 0.004126 0.977060 0.024205 0.927385 0.009792 0.038618 0.717626 0.112004 0.063153 0.107218 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA2338.1 MOTIF MA0065.2 Pparg::Rxra letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 857 E= 0 0.109685 0.369895 0.373396 0.147025 0.117716 0.193473 0.148019 0.540793 0.453488 0.026744 0.427907 0.091860 0.116144 0.003484 0.779326 0.101045 0.161253 0.017401 0.781903 0.039443 0.168213 0.149652 0.458237 0.223898 0.082271 0.633835 0.207416 0.076477 0.949015 0.024334 0.017381 0.009270 0.604867 0.055620 0.312862 0.026651 0.825231 0.005787 0.158565 0.010417 0.095017 0.002317 0.888760 0.013905 0.047509 0.010429 0.803013 0.139050 0.025492 0.114716 0.304751 0.555041 0.062645 0.643852 0.167053 0.126450 0.784223 0.067285 0.054524 0.093968 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0065.2 MOTIF MA0065.3 Pparg::Rxra letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 860 E= 0 0.453488 0.026744 0.427907 0.091860 0.116144 0.003484 0.779326 0.101045 0.161253 0.017401 0.781903 0.039443 0.168213 0.149652 0.458237 0.223898 0.082271 0.633835 0.207416 0.076477 0.949015 0.024334 0.017381 0.009270 0.604867 0.055620 0.312862 0.026651 0.825231 0.005787 0.158565 0.010417 0.095017 0.002317 0.888760 0.013905 0.047509 0.010429 0.803013 0.139050 0.025492 0.114716 0.304751 0.555041 0.062645 0.643852 0.167053 0.126450 0.784223 0.067285 0.054524 0.093968 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0065.3 MOTIF MA0200.1 Pph13 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 21 E= 0 0.285714 0.380952 0.142857 0.190476 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.047619 0.000000 0.952381 0.619048 0.047619 0.285714 0.047619 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0200.1 MOTIF MA0200.2 Pph13 letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 21 E= 0 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.047619 0.000000 0.952381 0.619048 0.047619 0.285714 0.047619 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0200.2 MOTIF MA1998.1 Prdm14 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 13841 E= 0 0.269561 0.267105 0.205187 0.258146 0.346073 0.104472 0.350553 0.198902 0.053103 0.078101 0.809118 0.059678 0.021169 0.041254 0.899285 0.038292 0.039304 0.027527 0.089155 0.844014 0.019291 0.903764 0.040604 0.036341 0.029983 0.092190 0.013222 0.864605 0.009537 0.869157 0.064374 0.056932 0.014667 0.020085 0.009248 0.956000 0.907377 0.036486 0.028394 0.027744 0.462322 0.160827 0.142620 0.234232 0.150856 0.413915 0.233509 0.201720 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1998.1