MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0729.1 RARA letter-probability matrix: alength= 4 w= 18 nsites= 768 E= 0 0.325521 0.001302 0.667969 0.005208 0.933702 0.001842 0.064457 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.001305 0.000000 0.973890 0.024804 0.000000 0.008850 0.001770 0.989381 0.002721 0.961905 0.035374 0.000000 0.992481 0.000000 0.007519 0.000000 0.734637 0.000000 0.039106 0.226257 0.929329 0.000000 0.005300 0.065371 0.983051 0.009416 0.007533 0.000000 0.000000 0.000000 0.998684 0.001316 0.000000 0.000000 0.881871 0.118129 0.005464 0.000000 0.000000 0.994536 0.000000 0.997171 0.000000 0.002829 0.998152 0.000000 0.001848 0.000000 0.685751 0.045802 0.038168 0.230280 0.003584 0.000000 0.408602 0.587814 0.000000 0.207957 0.408680 0.383363 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0729.1 MOTIF MA0730.1 RARA letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 1426 E= 0 0.763675 0.016830 0.219495 0.000000 0.000000 0.000000 0.998658 0.001342 0.000000 0.001312 0.952100 0.046588 0.005098 0.009346 0.014444 0.971113 0.004950 0.980198 0.004455 0.010396 0.979577 0.011268 0.007746 0.001408 0.220836 0.291269 0.061629 0.426266 0.146694 0.297521 0.402204 0.153581 0.099123 0.456507 0.105866 0.338503 0.641161 0.077836 0.130607 0.150396 0.731795 0.012257 0.250901 0.005047 0.797450 0.011331 0.190510 0.000708 0.001369 0.000000 0.995893 0.002738 0.000674 0.004720 0.971005 0.023601 0.006879 0.009458 0.011178 0.972485 0.002025 0.973671 0.013165 0.011139 0.975066 0.001969 0.016404 0.006562 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0730.1 MOTIF MA0159.1 RARA::RXRA letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 23 E= 0 0.521739 0.000000 0.478261 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.043478 0.000000 0.565217 0.391304 0.000000 0.000000 0.043478 0.956522 0.000000 0.782609 0.130435 0.086957 0.956522 0.000000 0.043478 0.000000 0.173913 0.304348 0.217391 0.304348 0.217391 0.347826 0.391304 0.043478 0.217391 0.173913 0.478261 0.130435 0.565217 0.043478 0.304348 0.086957 0.217391 0.260870 0.521739 0.000000 0.739130 0.130435 0.130435 0.000000 0.043478 0.043478 0.869565 0.043478 0.000000 0.043478 0.695652 0.260870 0.086957 0.043478 0.130435 0.739130 0.043478 0.739130 0.130435 0.086957 0.913043 0.000000 0.043478 0.043478 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0159.1 MOTIF MA1149.1 RARA::RXRG letter-probability matrix: alength= 4 w= 18 nsites= 1000 E= 0 0.345000 0.113000 0.413000 0.129000 0.496000 0.038000 0.460000 0.006000 0.013000 0.003000 0.954000 0.030000 0.011000 0.003000 0.828000 0.158000 0.005000 0.015000 0.071000 0.909000 0.018000 0.831000 0.058000 0.093000 0.874000 0.005000 0.111000 0.010000 0.272272 0.239239 0.154154 0.334334 0.215215 0.249249 0.320320 0.215215 0.211000 0.212000 0.272000 0.305000 0.343656 0.198801 0.230769 0.226773 0.348348 0.133133 0.397397 0.121121 0.495000 0.090000 0.390000 0.025000 0.026000 0.004000 0.927000 0.043000 0.011988 0.004995 0.814186 0.168831 0.060060 0.112112 0.226226 0.601602 0.072927 0.695305 0.096903 0.134865 0.701299 0.052947 0.205794 0.039960 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1149.1 MOTIF MA1149.2 RARA::RXRG letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 1000 E= 0 0.496000 0.038000 0.460000 0.006000 0.013000 0.003000 0.954000 0.030000 0.011000 0.003000 0.828000 0.158000 0.005000 0.015000 0.071000 0.909000 0.018000 0.831000 0.058000 0.093000 0.874000 0.005000 0.111000 0.010000 0.272272 0.239239 0.154154 0.334334 0.215215 0.249249 0.320320 0.215215 0.211000 0.212000 0.272000 0.305000 0.343656 0.198801 0.230769 0.226773 0.348348 0.133133 0.397397 0.121121 0.495000 0.090000 0.390000 0.025000 0.026000 0.004000 0.927000 0.043000 0.011988 0.004995 0.814186 0.168831 0.060060 0.112112 0.226226 0.601602 0.072927 0.695305 0.096903 0.134865 0.701299 0.052947 0.205794 0.039960 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1149.2 MOTIF MA1552.1 RARB letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 472 E= 0 0.459746 0.063559 0.358051 0.118644 0.698259 0.087041 0.214700 0.000000 0.005736 0.032505 0.902486 0.059273 0.017794 0.007117 0.839858 0.135231 0.034483 0.105090 0.085386 0.775041 0.010000 0.944000 0.014000 0.032000 0.677895 0.000000 0.315789 0.006316 0.006250 0.010417 0.000000 0.983333 0.032000 0.016000 0.944000 0.008000 0.892250 0.049149 0.034026 0.024575 0.136937 0.850450 0.000000 0.012613 0.023622 0.929134 0.015748 0.031496 0.018975 0.191651 0.085389 0.703985 0.133475 0.271186 0.116525 0.478814 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1552.1 MOTIF MA1552.2 RARB letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 472 E= 0 0.459746 0.063559 0.358051 0.118644 0.698259 0.087041 0.214700 0.000000 0.005736 0.032505 0.902486 0.059273 0.017794 0.007117 0.839858 0.135231 0.034483 0.105090 0.085386 0.775041 0.010000 0.944000 0.014000 0.032000 0.677895 0.000000 0.315789 0.006316 0.006250 0.010417 0.000000 0.983333 0.032000 0.016000 0.944000 0.008000 0.892250 0.049149 0.034026 0.024575 0.136937 0.850450 0.000000 0.012613 0.023622 0.929134 0.015748 0.031496 0.018975 0.191651 0.085389 0.703985 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1552.2 MOTIF MA1553.1 RARG letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 3442 E= 0 0.490703 0.085997 0.284137 0.139163 0.711231 0.085523 0.175425 0.027821 0.029632 0.009877 0.918847 0.041644 0.008445 0.006063 0.745344 0.240147 0.078146 0.066561 0.073376 0.781917 0.007613 0.935835 0.015769 0.040783 0.750648 0.002591 0.240426 0.006335 0.009327 0.014132 0.003674 0.972866 0.025341 0.012810 0.958507 0.003342 0.867877 0.049420 0.032274 0.050429 0.223743 0.772442 0.001122 0.002693 0.029330 0.952407 0.004981 0.013282 0.014316 0.182131 0.072906 0.730647 0.124020 0.289863 0.081905 0.504211 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1553.1 MOTIF MA1553.2 RARG letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 3882 E= 0 0.711231 0.085523 0.175425 0.027821 0.029632 0.009877 0.918847 0.041644 0.008445 0.006063 0.745344 0.240147 0.078146 0.066561 0.073376 0.781917 0.007613 0.935835 0.015769 0.040783 0.750648 0.002591 0.240426 0.006335 0.009327 0.014132 0.003674 0.972866 0.025341 0.012810 0.958507 0.003342 0.867877 0.049420 0.032274 0.050429 0.223743 0.772442 0.001122 0.002693 0.029330 0.952407 0.004981 0.013282 0.014316 0.182131 0.072906 0.730647 0.124020 0.289863 0.081905 0.504211 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1553.2 MOTIF MA0582.1 RAV1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 49 E= 0 0.285714 0.346939 0.244898 0.122449 0.313725 0.215686 0.196078 0.274510 0.122807 0.245614 0.614035 0.017544 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.691176 0.176471 0.132353 0.000000 0.898551 0.057971 0.043478 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.130435 0.101449 0.463768 0.304348 0.594203 0.057971 0.057971 0.289855 0.492754 0.086957 0.144928 0.275362 0.391304 0.130435 0.246377 0.231884 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0582.1