MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA1910.1 Rax letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1000 E= 0 0.306000 0.183000 0.211000 0.300000 0.311688 0.186813 0.220779 0.280719 0.289710 0.196803 0.220779 0.292707 0.241241 0.215215 0.224224 0.319319 0.260739 0.210789 0.236763 0.291708 0.333000 0.203000 0.245000 0.219000 0.333000 0.190000 0.249000 0.228000 0.082082 0.095095 0.084084 0.738739 0.048000 0.050000 0.029000 0.873000 0.883000 0.028000 0.051000 0.038000 0.909910 0.020020 0.037037 0.033033 0.047047 0.037037 0.037037 0.878879 0.052000 0.056000 0.060000 0.832000 0.364364 0.153153 0.266266 0.216216 0.304304 0.200200 0.284284 0.211211 0.255000 0.221000 0.234000 0.290000 0.232767 0.207792 0.214785 0.344655 0.275000 0.202000 0.216000 0.307000 0.314685 0.190809 0.214785 0.279720 0.291708 0.190809 0.219780 0.297702 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1910.1 MOTIF MA1910.2 Rax letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 999 E= 0 0.082082 0.095095 0.084084 0.738739 0.048000 0.050000 0.029000 0.873000 0.883000 0.028000 0.051000 0.038000 0.909910 0.020020 0.037037 0.033033 0.047047 0.037037 0.037037 0.878879 0.052000 0.056000 0.060000 0.832000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1910.2 MOTIF MA1911.1 Rel letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1000 E= 0 0.242000 0.229000 0.266000 0.263000 0.247000 0.221000 0.275000 0.257000 0.247000 0.221000 0.269000 0.263000 0.226000 0.224000 0.272000 0.278000 0.219000 0.222000 0.270000 0.289000 0.161838 0.233766 0.320679 0.283716 0.071000 0.184000 0.556000 0.189000 0.008000 0.006000 0.977000 0.009000 0.114885 0.005994 0.844156 0.034965 0.832000 0.007000 0.118000 0.043000 0.859000 0.021000 0.022000 0.098000 0.185000 0.011000 0.015000 0.789000 0.014000 0.022000 0.008000 0.956000 0.092000 0.323000 0.038000 0.547000 0.068931 0.668332 0.045954 0.216783 0.102897 0.628372 0.138861 0.129870 0.219000 0.329000 0.280000 0.172000 0.248751 0.251748 0.248751 0.250749 0.250000 0.224000 0.256000 0.270000 0.238000 0.227000 0.260000 0.275000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1911.1 MOTIF MA2264.1 Rel letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 998 E= 0 0.005010 0.026052 0.911824 0.057114 0.007007 0.000000 0.992993 0.000000 0.000000 0.009009 0.936937 0.054054 0.000000 0.001001 0.993994 0.005005 0.118355 0.017051 0.858576 0.006018 0.064128 0.001002 0.000000 0.934870 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.003003 0.986987 0.006006 0.004004 0.037037 0.962963 0.000000 0.000000 0.004004 0.995996 0.000000 0.000000 0.005005 0.983984 0.000000 0.011011 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA2264.1 MOTIF MA1911.2 Rel letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1000 E= 0 0.071000 0.184000 0.556000 0.189000 0.008000 0.006000 0.977000 0.009000 0.114885 0.005994 0.844156 0.034965 0.832000 0.007000 0.118000 0.043000 0.859000 0.021000 0.022000 0.098000 0.185000 0.011000 0.015000 0.789000 0.014000 0.022000 0.008000 0.956000 0.092000 0.323000 0.038000 0.547000 0.068931 0.668332 0.045954 0.216783 0.102897 0.628372 0.138861 0.129870 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1911.2 MOTIF MA2266.1 Rfx letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 1000 E= 0 0.016736 0.000000 0.953975 0.029289 0.013672 0.000000 0.000000 0.986328 0.020873 0.053131 0.000000 0.925996 0.034043 0.023404 0.942553 0.000000 0.005871 0.984344 0.005871 0.003914 0.000000 0.028000 0.000000 0.972000 0.950100 0.011976 0.000000 0.037924 0.371795 0.049145 0.561966 0.017094 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.027473 0.919414 0.000000 0.053114 0.914019 0.007477 0.033645 0.044860 0.984190 0.009881 0.005929 0.000000 0.007678 0.980806 0.000000 0.011516 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA2266.1 MOTIF MA0509.1 Rfx1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 2138 E= 0 0.135641 0.073433 0.716558 0.074369 0.027128 0.103835 0.176333 0.692703 0.067820 0.389616 0.061272 0.481291 0.196913 0.202526 0.356408 0.244153 0.017306 0.817587 0.044902 0.120206 0.000000 0.957905 0.000000 0.042095 0.586529 0.188026 0.034144 0.191300 0.064546 0.053789 0.044902 0.836763 0.282507 0.000000 0.717493 0.000000 0.086997 0.000000 0.913003 0.000000 0.134238 0.799813 0.005613 0.060337 0.838634 0.000000 0.114125 0.047240 0.973807 0.000000 0.026193 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0509.1 MOTIF MA1724.1 Rfx6 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 8550 E= 0 0.235673 0.238947 0.146082 0.379298 0.229240 0.242105 0.235673 0.292982 0.021871 0.919181 0.027135 0.031813 0.127836 0.749123 0.028304 0.094737 0.040234 0.124678 0.017076 0.818012 0.843860 0.007485 0.140936 0.007719 0.020936 0.011930 0.960819 0.006316 0.044211 0.874152 0.041988 0.039649 0.945614 0.013684 0.015439 0.025263 0.905263 0.030175 0.039649 0.024912 0.064561 0.796608 0.064561 0.074269 0.321053 0.339415 0.163392 0.176140 0.265263 0.222807 0.344444 0.167485 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1724.1 MOTIF MA1724.2 Rfx6 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 8550 E= 0 0.021871 0.919181 0.027135 0.031813 0.127836 0.749123 0.028304 0.094737 0.040234 0.124678 0.017076 0.818012 0.843860 0.007485 0.140936 0.007719 0.020936 0.011930 0.960819 0.006316 0.044211 0.874152 0.041988 0.039649 0.945614 0.013684 0.015439 0.025263 0.905263 0.030175 0.039649 0.024912 0.064561 0.796608 0.064561 0.074269 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1724.2 MOTIF MA0629.1 Rhox11 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.540000 0.130000 0.150000 0.180000 0.326733 0.277228 0.227723 0.168317 0.171717 0.111111 0.383838 0.333333 0.300000 0.280000 0.230000 0.190000 0.130000 0.560000 0.060000 0.250000 0.030000 0.010000 0.950000 0.010000 0.090000 0.760000 0.150000 0.000000 0.009901 0.000000 0.009901 0.980198 0.040000 0.000000 0.940000 0.020000 0.009901 0.009901 0.000000 0.980198 0.565657 0.000000 0.000000 0.434343 0.780000 0.040000 0.030000 0.150000 0.525253 0.101010 0.010101 0.363636 0.313131 0.111111 0.333333 0.242424 0.240000 0.360000 0.280000 0.120000 0.310000 0.160000 0.430000 0.100000 0.414141 0.131313 0.101010 0.353535 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0629.1