MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0720.2 Shox2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 19386 E= 0 0.050500 0.465645 0.011761 0.472093 0.909086 0.031305 0.021303 0.038306 0.988043 0.007500 0.000163 0.004294 0.001592 0.000659 0.000000 0.997750 0.029568 0.026992 0.043089 0.900352 0.941771 0.009998 0.001865 0.046366 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0720.2 MOTIF UN0469.1 Six1-2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1000 E= 0 0.250000 0.262000 0.237000 0.251000 0.244000 0.223000 0.314000 0.219000 0.274000 0.228000 0.221000 0.277000 0.338000 0.248000 0.186000 0.228000 0.416000 0.195000 0.173000 0.216000 0.262262 0.290290 0.180180 0.267267 0.309000 0.240000 0.220000 0.231000 0.052947 0.074925 0.049950 0.822178 0.083000 0.034000 0.826000 0.057000 0.884000 0.023000 0.022000 0.071000 0.066000 0.072000 0.025000 0.837000 0.900000 0.050000 0.026000 0.024000 0.035035 0.846847 0.041041 0.077077 0.238000 0.340000 0.235000 0.187000 0.239000 0.298000 0.224000 0.239000 0.263000 0.235000 0.243000 0.259000 0.351000 0.211000 0.192000 0.246000 0.261000 0.271000 0.198000 0.270000 0.285000 0.297000 0.190000 0.228000 0.245000 0.331000 0.198000 0.226000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/UN0469.1 MOTIF UN0469.2 Six1-2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 1001 E= 0 0.052947 0.074925 0.049950 0.822178 0.083000 0.034000 0.826000 0.057000 0.884000 0.023000 0.022000 0.071000 0.066000 0.072000 0.025000 0.837000 0.900000 0.050000 0.026000 0.024000 0.035035 0.846847 0.041041 0.077077 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/UN0469.2 MOTIF MA0631.1 Six3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 99 E= 0 0.333333 0.090909 0.363636 0.212121 0.720000 0.080000 0.080000 0.120000 0.230000 0.050000 0.170000 0.550000 0.474747 0.101010 0.323232 0.101010 0.070000 0.070000 0.820000 0.040000 0.019802 0.019802 0.891089 0.069307 0.160000 0.010000 0.830000 0.000000 0.000000 0.000000 0.040404 0.959596 0.970000 0.000000 0.030000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.010101 0.979798 0.000000 0.010101 0.920000 0.030000 0.030000 0.020000 0.190000 0.450000 0.090000 0.270000 0.250000 0.230000 0.200000 0.320000 0.404040 0.080808 0.111111 0.404040 0.336634 0.217822 0.178218 0.267327 0.079208 0.108911 0.237624 0.574257 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0631.1 MOTIF MA0631.2 Six3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 0 0.720000 0.080000 0.080000 0.120000 0.230000 0.050000 0.170000 0.550000 0.474747 0.101010 0.323232 0.101010 0.070000 0.070000 0.820000 0.040000 0.019802 0.019802 0.891089 0.069307 0.160000 0.010000 0.830000 0.000000 0.000000 0.000000 0.040404 0.959596 0.970000 0.000000 0.030000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.010101 0.979798 0.000000 0.010101 0.920000 0.030000 0.030000 0.020000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0631.2 MOTIF MA1912.1 Six3/6 letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1000 E= 0 0.260000 0.242000 0.222000 0.276000 0.226773 0.205794 0.247752 0.319680 0.225000 0.185000 0.348000 0.242000 0.325000 0.181000 0.174000 0.320000 0.412587 0.194805 0.158841 0.233766 0.409409 0.187187 0.145145 0.258258 0.309000 0.175000 0.208000 0.308000 0.038038 0.086086 0.042042 0.833834 0.051948 0.025974 0.889111 0.032967 0.964000 0.010000 0.009000 0.017000 0.021000 0.051000 0.009000 0.919000 0.930000 0.049000 0.012000 0.009000 0.021021 0.710711 0.072072 0.196196 0.177000 0.351000 0.290000 0.182000 0.189810 0.301698 0.264735 0.243756 0.242242 0.264264 0.234234 0.259259 0.267000 0.212000 0.184000 0.337000 0.307000 0.255000 0.172000 0.266000 0.297702 0.246753 0.185814 0.269730 0.268000 0.265000 0.203000 0.264000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1912.1 MOTIF MA1912.2 Six3/6 letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 999 E= 0 0.038038 0.086086 0.042042 0.833834 0.051948 0.025974 0.889111 0.032967 0.964000 0.010000 0.009000 0.017000 0.021000 0.051000 0.009000 0.919000 0.930000 0.049000 0.012000 0.009000 0.021021 0.710711 0.072072 0.196196 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1912.2 MOTIF MA0204.1 Six4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 20 E= 0 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.350000 0.200000 0.450000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.050000 0.950000 0.000000 0.000000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0204.1 MOTIF MA2001.1 Six4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 4291 E= 0 0.163365 0.109765 0.593102 0.133768 0.348404 0.146586 0.181543 0.323468 0.946866 0.023072 0.013284 0.016779 0.925192 0.026101 0.014449 0.034258 0.048707 0.817059 0.026800 0.107434 0.111862 0.781170 0.026567 0.080401 0.047075 0.062456 0.048940 0.841529 0.028898 0.034025 0.910277 0.026800 0.961081 0.014449 0.012118 0.012351 0.194593 0.259147 0.288744 0.257516 0.313214 0.326730 0.159869 0.200186 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA2001.1 MOTIF MA2001.2 Six4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 4291 E= 0 0.946866 0.023072 0.013284 0.016779 0.925192 0.026101 0.014449 0.034258 0.048707 0.817059 0.026800 0.107434 0.111862 0.781170 0.026567 0.080401 0.047075 0.062456 0.048940 0.841529 0.028898 0.034025 0.910277 0.026800 0.961081 0.014449 0.012118 0.012351 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA2001.2