MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA2275.1 Sox15 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 999 E= 0 0.571429 0.047619 0.238095 0.142857 0.619048 0.095238 0.095238 0.190476 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.142857 0.000000 0.000000 0.857143 0.285714 0.000000 0.666667 0.047619 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA2275.1 MOTIF MA0078.1 Sox17 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 31 E= 0 0.225806 0.290323 0.193548 0.290323 0.258065 0.258065 0.129032 0.354839 0.096774 0.580645 0.032258 0.290323 0.967742 0.000000 0.000000 0.032258 0.000000 0.032258 0.000000 0.967742 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.064516 0.935484 0.000000 0.548387 0.322581 0.129032 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0078.1 MOTIF MA0078.2 Sox17 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 12287 E= 0 0.278180 0.214292 0.272564 0.234964 0.282412 0.274274 0.253601 0.189713 0.637747 0.077887 0.153740 0.130626 0.221372 0.072027 0.540246 0.166355 0.708717 0.090421 0.127045 0.073818 0.961830 0.010092 0.013266 0.014812 0.022056 0.914869 0.039880 0.023195 0.968992 0.011394 0.008546 0.011069 0.946854 0.020998 0.022870 0.009278 0.081794 0.011231 0.015382 0.891593 0.107756 0.020428 0.833483 0.038333 0.099617 0.082363 0.747213 0.070807 0.299748 0.274518 0.246114 0.179621 0.273297 0.258485 0.224302 0.243916 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0078.2 MOTIF MA0078.3 Sox17 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 12287 E= 0 0.637747 0.077887 0.153740 0.130626 0.221372 0.072027 0.540246 0.166355 0.708717 0.090421 0.127045 0.073818 0.961830 0.010092 0.013266 0.014812 0.022056 0.914869 0.039880 0.023195 0.968992 0.011394 0.008546 0.011069 0.946854 0.020998 0.022870 0.009278 0.081794 0.011231 0.015382 0.891593 0.107756 0.020428 0.833483 0.038333 0.099617 0.082363 0.747213 0.070807 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0078.3 MOTIF MA0143.1 Sox2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 667 E= 0 0.040480 0.665667 0.133433 0.160420 0.029895 0.677130 0.032885 0.260090 0.488789 0.010463 0.005979 0.494768 0.002990 0.014948 0.010463 0.971599 0.020927 0.001495 0.008969 0.968610 0.056801 0.124066 0.790732 0.028401 0.127246 0.005988 0.013473 0.853293 0.095808 0.290419 0.115269 0.498503 0.612613 0.186186 0.057057 0.144144 0.039039 0.058559 0.039039 0.863363 0.040602 0.115789 0.667669 0.175940 0.048120 0.634586 0.126316 0.190977 0.641566 0.061747 0.054217 0.242470 0.551205 0.100904 0.236446 0.111446 0.730422 0.090361 0.091867 0.087349 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0143.1 MOTIF MA0143.2 Sox2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 669 E= 0 0.040359 0.666667 0.133034 0.159940 0.029895 0.678625 0.032885 0.258595 0.491779 0.008969 0.004484 0.494768 0.002990 0.014948 0.008969 0.973094 0.020927 0.000000 0.008969 0.970105 0.053812 0.124066 0.793722 0.028401 0.127246 0.005988 0.011976 0.854790 0.094311 0.291916 0.113772 0.500000 0.611111 0.187688 0.057057 0.144144 0.039039 0.055556 0.039039 0.866366 0.039098 0.115789 0.669173 0.175940 0.046617 0.636090 0.126316 0.190977 0.641566 0.063253 0.055723 0.239458 0.552711 0.100904 0.234940 0.111446 0.732628 0.090634 0.089124 0.087613 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0143.2 MOTIF MA0143.3 Sox2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1476 E= 0 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.453252 0.000000 0.000000 0.546748 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.283875 0.201220 0.514905 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0143.3 MOTIF MA2276.1 Sox21a letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 998 E= 0 0.605210 0.178357 0.117234 0.099198 0.941825 0.016048 0.034102 0.008024 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.996997 0.000000 0.000000 0.003003 0.605210 0.391784 0.002004 0.001002 0.000000 0.001002 0.002004 0.996994 0.743487 0.005010 0.132265 0.119238 0.328657 0.340681 0.224449 0.106212 0.001002 0.996994 0.000000 0.002004 0.997996 0.002004 0.000000 0.000000 0.000000 0.002004 0.206413 0.791583 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.004004 0.000000 0.995996 0.000000 0.004008 0.134269 0.026052 0.835671 0.078156 0.102204 0.165331 0.654309 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA2276.1 MOTIF MA2277.1 Sox21b letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 998 E= 0 0.997996 0.000000 0.001002 0.001002 0.995992 0.001002 0.002004 0.001002 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.995996 0.000000 0.001001 0.003003 0.686058 0.313942 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.441884 0.000000 0.013026 0.545090 0.273547 0.172345 0.254509 0.299599 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.519038 0.480962 0.000000 0.001002 0.000000 0.998998 0.001001 0.000000 0.998999 0.000000 0.002006 0.000000 0.004012 0.993982 0.001001 0.002002 0.001001 0.995996 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA2277.1 MOTIF MA0514.1 Sox3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 2067 E= 0 0.000000 0.719400 0.159652 0.120948 0.000000 0.750847 0.000000 0.249153 0.126754 0.000000 0.000000 0.873246 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.069666 0.930334 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.337687 0.122883 0.539429 0.009192 0.412675 0.010643 0.567489 0.020319 0.316401 0.184809 0.478471 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0514.1