MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0514.2 Sox3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 11978 E= 0 0.312657 0.153114 0.290366 0.243864 0.341626 0.231842 0.246285 0.180247 0.981883 0.004341 0.006345 0.007430 0.012523 0.928786 0.014861 0.043830 0.942060 0.026048 0.007764 0.024128 0.970362 0.011939 0.011939 0.005761 0.047838 0.012523 0.008683 0.930957 0.134997 0.011104 0.838287 0.015612 0.146853 0.132075 0.639840 0.081232 0.287444 0.284438 0.243363 0.184755 0.288445 0.241025 0.242945 0.227584 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0514.2 MOTIF MA0514.3 Sox3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 11978 E= 0 0.981883 0.004341 0.006345 0.007430 0.012523 0.928786 0.014861 0.043830 0.942060 0.026048 0.007764 0.024128 0.970362 0.011939 0.011939 0.005761 0.047838 0.012523 0.008683 0.930957 0.134997 0.011104 0.838287 0.015612 0.146853 0.132075 0.639840 0.081232 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0514.3 MOTIF MA0087.1 Sox5 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 23 E= 0 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.043478 0.956522 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.043478 0.000000 0.956522 0.000000 0.000000 0.043478 0.000000 0.956522 0.043478 0.043478 0.000000 0.913043 0.347826 0.130435 0.173913 0.347826 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0087.1 MOTIF MA0087.2 Sox5 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 124 E= 0 0.250000 0.193548 0.387097 0.169355 0.427419 0.177419 0.274194 0.120968 0.217742 0.258065 0.387097 0.137097 0.838710 0.032258 0.096774 0.032258 0.983871 0.000000 0.008065 0.008065 0.000000 0.967742 0.016129 0.016129 0.967742 0.016129 0.016129 0.000000 0.919355 0.040323 0.032258 0.008065 0.048387 0.024194 0.008065 0.919355 0.161290 0.000000 0.814516 0.024194 0.104839 0.112903 0.725806 0.056452 0.177419 0.290323 0.322581 0.209677 0.298387 0.274194 0.209677 0.217742 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0087.2 MOTIF MA0087.3 Sox5 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 124 E= 0 0.838710 0.032258 0.096774 0.032258 0.983871 0.000000 0.008065 0.008065 0.000000 0.967742 0.016129 0.016129 0.967742 0.016129 0.016129 0.000000 0.919355 0.040323 0.032258 0.008065 0.048387 0.024194 0.008065 0.919355 0.161290 0.000000 0.814516 0.024194 0.104839 0.112903 0.725806 0.056452 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0087.3 MOTIF MA0515.1 Sox6 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 249 E= 0 0.016064 0.558233 0.200803 0.224900 0.000000 0.887550 0.000000 0.112450 0.646586 0.000000 0.000000 0.353414 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.461847 0.020080 0.518072 0.016064 0.449799 0.000000 0.534137 0.056225 0.305221 0.124498 0.514056 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0515.1 MOTIF MA2095.1 Sox7 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 2431 E= 0 0.631839 0.056767 0.203209 0.108186 0.188400 0.057589 0.701769 0.052242 0.838749 0.033320 0.116413 0.011518 0.986837 0.004525 0.003291 0.005348 0.008227 0.973673 0.010695 0.007404 0.984369 0.006170 0.003291 0.006170 0.982723 0.003702 0.007816 0.005759 0.046894 0.004114 0.003702 0.945290 0.145208 0.009872 0.826409 0.018511 0.114356 0.092555 0.763060 0.030029 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA2095.1 MOTIF MA1915.1 SoxB1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1000 E= 0 0.475000 0.288000 0.075000 0.162000 0.366000 0.436000 0.077000 0.121000 0.711000 0.066000 0.071000 0.152000 0.517000 0.084000 0.099000 0.300000 0.183816 0.100899 0.169830 0.545455 0.282000 0.148000 0.297000 0.273000 0.301000 0.247000 0.198000 0.254000 0.131000 0.672000 0.037000 0.160000 0.973000 0.005000 0.008000 0.014000 0.124000 0.010000 0.011000 0.855000 0.008000 0.006000 0.007000 0.979000 0.042042 0.030030 0.913914 0.014014 0.077000 0.032000 0.030000 0.861000 0.218781 0.212787 0.216783 0.351648 0.316000 0.244000 0.169000 0.271000 0.246000 0.202000 0.190000 0.362000 0.213786 0.188811 0.198801 0.398601 0.206000 0.178000 0.336000 0.280000 0.249000 0.170000 0.251000 0.330000 0.253000 0.196000 0.226000 0.325000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1915.1 MOTIF MA1915.2 SoxB1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 1000 E= 0 0.711000 0.066000 0.071000 0.152000 0.517000 0.084000 0.099000 0.300000 0.183816 0.100899 0.169830 0.545455 0.282000 0.148000 0.297000 0.273000 0.301000 0.247000 0.198000 0.254000 0.131000 0.672000 0.037000 0.160000 0.973000 0.005000 0.008000 0.014000 0.124000 0.010000 0.011000 0.855000 0.008000 0.006000 0.007000 0.979000 0.042042 0.030030 0.913914 0.014014 0.077000 0.032000 0.030000 0.861000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1915.2 MOTIF MA1916.1 SoxB2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1000 E= 0 0.350000 0.173000 0.200000 0.277000 0.356000 0.149000 0.220000 0.275000 0.339339 0.160160 0.232232 0.268268 0.276000 0.183000 0.242000 0.299000 0.246000 0.209000 0.269000 0.276000 0.121000 0.402000 0.226000 0.251000 0.186000 0.374000 0.064000 0.376000 0.873127 0.006993 0.019980 0.099900 0.015984 0.007992 0.008991 0.967033 0.019000 0.007000 0.019000 0.955000 0.048000 0.023000 0.919000 0.010000 0.022000 0.018000 0.014000 0.946000 0.101000 0.103000 0.102000 0.694000 0.233233 0.240240 0.147147 0.379379 0.230000 0.206000 0.190000 0.374000 0.238761 0.250749 0.213786 0.296703 0.245245 0.239239 0.209209 0.306306 0.242000 0.230000 0.197000 0.331000 0.245000 0.232000 0.180000 0.343000 0.253746 0.221778 0.166833 0.357642 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1916.1