MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA1916.2 SoxB2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 1001 E= 0 0.873127 0.006993 0.019980 0.099900 0.015984 0.007992 0.008991 0.967033 0.019000 0.007000 0.019000 0.955000 0.048000 0.023000 0.919000 0.010000 0.022000 0.018000 0.014000 0.946000 0.101000 0.103000 0.102000 0.694000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1916.2 MOTIF MA1917.1 SoxC letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1000 E= 0 0.305000 0.250000 0.203000 0.242000 0.364000 0.175000 0.207000 0.254000 0.316316 0.184184 0.220220 0.279279 0.256743 0.188811 0.228771 0.325674 0.268000 0.196000 0.247000 0.289000 0.240000 0.240000 0.231000 0.289000 0.256000 0.276000 0.170000 0.298000 0.805000 0.035000 0.063000 0.097000 0.051000 0.034000 0.042000 0.873000 0.033000 0.024000 0.034000 0.909000 0.060060 0.042042 0.849850 0.048048 0.050949 0.033966 0.037962 0.877123 0.065934 0.058941 0.071928 0.803197 0.246246 0.215215 0.234234 0.304304 0.241241 0.208208 0.229229 0.321321 0.243756 0.208791 0.235764 0.311688 0.242757 0.219780 0.237762 0.299700 0.254745 0.214785 0.234765 0.295704 0.256000 0.216000 0.232000 0.296000 0.257000 0.219000 0.232000 0.292000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1917.1 MOTIF MA1917.2 SoxC letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 1000 E= 0 0.805000 0.035000 0.063000 0.097000 0.051000 0.034000 0.042000 0.873000 0.033000 0.024000 0.034000 0.909000 0.060060 0.042042 0.849850 0.048048 0.050949 0.033966 0.037962 0.877123 0.065934 0.058941 0.071928 0.803197 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1917.2 MOTIF MA1918.1 SoxF letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1000 E= 0 0.418000 0.238000 0.133000 0.211000 0.472000 0.103000 0.159000 0.266000 0.374000 0.130000 0.191000 0.305000 0.262262 0.150150 0.220220 0.367367 0.293293 0.176176 0.246246 0.284284 0.188000 0.350000 0.204000 0.258000 0.285000 0.327000 0.094000 0.294000 0.958000 0.006000 0.013000 0.023000 0.035000 0.010000 0.009000 0.946000 0.015000 0.008000 0.015000 0.962000 0.063936 0.028971 0.887113 0.019980 0.043000 0.022000 0.020000 0.915000 0.116000 0.123000 0.099000 0.662000 0.254000 0.260000 0.157000 0.329000 0.235000 0.208000 0.179000 0.378000 0.243000 0.212000 0.195000 0.350000 0.242000 0.217000 0.226000 0.315000 0.277000 0.188000 0.216000 0.319000 0.290000 0.177000 0.203000 0.330000 0.303000 0.187000 0.198000 0.312000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1918.1 MOTIF MA1918.2 SoxF letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 1000 E= 0 0.958000 0.006000 0.013000 0.023000 0.035000 0.010000 0.009000 0.946000 0.015000 0.008000 0.015000 0.962000 0.063936 0.028971 0.887113 0.019980 0.043000 0.022000 0.020000 0.915000 0.116000 0.123000 0.099000 0.662000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1918.2 MOTIF MA2278.1 SoxN letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 999 E= 0 0.000000 0.995996 0.004004 0.000000 0.926780 0.031093 0.023069 0.019057 0.827655 0.113226 0.010020 0.049098 0.000000 0.033033 0.004004 0.962963 0.416416 0.133133 0.244244 0.206206 0.363727 0.230461 0.290581 0.115230 0.020040 0.955912 0.024048 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.050100 0.021042 0.083166 0.845691 0.020040 0.008016 0.012024 0.959920 0.052000 0.016000 0.932000 0.000000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA2278.1 MOTIF MA2279.1 Sp1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 997 E= 0 0.159478 0.589769 0.027081 0.223671 0.511022 0.487976 0.001002 0.000000 0.026026 0.968969 0.000000 0.005005 0.067134 0.000000 0.886774 0.046092 0.012012 0.987988 0.000000 0.000000 0.017017 0.977978 0.000000 0.005005 0.015030 0.858717 0.000000 0.126253 0.470942 0.411824 0.003006 0.114228 0.102102 0.618619 0.057057 0.222222 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA2279.1 MOTIF MA0080.3 Spi1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 63715 E= 0 0.391697 0.164326 0.275555 0.168422 0.424876 0.123597 0.345617 0.105909 0.611567 0.051966 0.216370 0.120097 0.663125 0.048701 0.188841 0.099333 0.607110 0.008381 0.180224 0.204285 0.197395 0.127443 0.675163 0.000000 0.711857 0.050365 0.230448 0.007330 0.075351 0.000000 0.924649 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.999215 0.000000 0.000785 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.053928 0.159225 0.786848 0.000000 0.129483 0.050585 0.053127 0.766805 0.061100 0.188935 0.714133 0.035831 0.343891 0.188778 0.329640 0.137691 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0080.3 MOTIF MA0080.6 Spi1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 105198 E= 0 0.394485 0.147037 0.262961 0.195517 0.356670 0.141647 0.348191 0.153492 0.632436 0.065239 0.216801 0.085524 0.782144 0.054735 0.100895 0.062226 0.774359 0.022149 0.097150 0.106342 0.082093 0.115981 0.760338 0.041588 0.855073 0.024658 0.091599 0.028670 0.038755 0.005228 0.944505 0.011512 0.019278 0.007899 0.963735 0.009088 0.969714 0.010409 0.010105 0.009772 0.946111 0.009107 0.017320 0.027462 0.072397 0.067178 0.847355 0.013071 0.161572 0.035324 0.048746 0.754358 0.094793 0.057748 0.792648 0.054811 0.220479 0.110050 0.548195 0.121276 0.373828 0.165716 0.264958 0.195498 0.355225 0.162199 0.249159 0.233417 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0080.6 MOTIF MA0080.7 Spi1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 105198 E= 0 0.632436 0.065239 0.216801 0.085524 0.782144 0.054735 0.100895 0.062226 0.774359 0.022149 0.097150 0.106342 0.082093 0.115981 0.760338 0.041588 0.855073 0.024658 0.091599 0.028670 0.038755 0.005228 0.944505 0.011512 0.019278 0.007899 0.963735 0.009088 0.969714 0.010409 0.010105 0.009772 0.946111 0.009107 0.017320 0.027462 0.072397 0.067178 0.847355 0.013071 0.161572 0.035324 0.048746 0.754358 0.094793 0.057748 0.792648 0.054811 0.220479 0.110050 0.548195 0.121276 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0080.7