MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF UN1291.1 TraesCS6D02G225700
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 29334 E= 0
 0.100668  0.582600  0.186848  0.129883
 0.091873  0.670928  0.157258  0.079941
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000034  0.000000  0.999966  0.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.126304  0.118600  0.660701  0.094396
 0.094805  0.612225  0.176076  0.116895
 0.093202  0.598043  0.210813  0.097941
URL https://jaspar.elixir.no/matrix/UN1291.1

MOTIF UN1288.1 TraesCS7A02G299600
letter-probability matrix: alength= 4 w= 21 nsites= 112 E= 0
 0.428571  0.187500  0.035714  0.348214
 0.133929  0.017857  0.008929  0.839286
 0.107143  0.008929  0.026786  0.857143
 0.383929  0.116071  0.428571  0.071429
 0.008929  0.973214  0.008929  0.008929
 0.008929  0.000000  0.000000  0.991071
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.758929  0.169643  0.053571  0.017857
 0.491071  0.044643  0.428571  0.035714
 0.044643  0.267857  0.107143  0.580357
 0.151786  0.348214  0.366071  0.133929
 0.589286  0.080357  0.258929  0.071429
 0.044643  0.419643  0.035714  0.500000
 0.026786  0.080357  0.160714  0.732143
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.982143  0.000000  0.008929  0.008929
 0.000000  0.008929  0.991071  0.000000
 0.062500  0.357143  0.116071  0.464286
 0.866071  0.026786  0.000000  0.107143
 0.857143  0.008929  0.017857  0.116071
 0.392857  0.026786  0.160714  0.419643
URL https://jaspar.elixir.no/matrix/UN1288.1

MOTIF UN1287.1 TraesCS7A02G357500
letter-probability matrix: alength= 4 w= 21 nsites= 2356 E= 0
 0.233871  0.049660  0.595076  0.121392
 0.461800  0.070458  0.006367  0.461375
 0.688879  0.005093  0.231324  0.074703
 0.131154  0.072156  0.663837  0.132852
 0.006791  0.927844  0.059423  0.005942
 0.054329  0.026316  0.030136  0.889219
 0.008065  0.000849  0.000424  0.990662
 0.245756  0.593803  0.149406  0.011036
 0.089983  0.381579  0.039898  0.488540
 0.303056  0.311121  0.206282  0.179542
 0.151952  0.386672  0.306027  0.155348
 0.197793  0.213497  0.283531  0.305178
 0.567063  0.058149  0.296689  0.078098
 0.012309  0.126910  0.699066  0.161715
 0.987267  0.000000  0.007216  0.005518
 0.981324  0.012309  0.001698  0.004669
 0.002971  0.001698  0.993209  0.002122
 0.164261  0.696520  0.059423  0.079796
 0.065789  0.223260  0.003396  0.707555
 0.371817  0.010187  0.007216  0.610781
 0.093803  0.734720  0.050085  0.121392
URL https://jaspar.elixir.no/matrix/UN1287.1

MOTIF MA2750.1 TraesCS7B02G142200
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 1319 E= 0
 0.078089  0.227445  0.061410  0.633055
 0.015921  0.018196  0.962851  0.003033
 0.007582  0.021228  0.019712  0.951478
 0.949962  0.025019  0.011372  0.013647
 0.006065  0.965125  0.006823  0.021986
 0.009098  0.008340  0.975739  0.006823
 0.016679  0.018196  0.787718  0.177407
 0.857468  0.062168  0.026535  0.053829
 0.206975  0.561789  0.081880  0.149356
URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA2750.1

MOTIF UN1290.1 TraesCS7D02G295100
letter-probability matrix: alength= 4 w= 19 nsites= 344 E= 0
 0.125000  0.008721  0.005814  0.860465
 0.072674  0.002907  0.072674  0.851744
 0.473837  0.133721  0.316860  0.075581
 0.005814  0.985465  0.002907  0.005814
 0.005814  0.002907  0.000000  0.991279
 0.002907  0.005814  0.005814  0.985465
 0.712209  0.180233  0.034884  0.072674
 0.555233  0.046512  0.331395  0.066860
 0.052326  0.250000  0.095930  0.601744
 0.174419  0.351744  0.331395  0.142442
 0.598837  0.098837  0.247093  0.055233
 0.066860  0.351744  0.049419  0.531977
 0.072674  0.034884  0.171512  0.720930
 0.994186  0.005814  0.000000  0.000000
 0.994186  0.000000  0.002907  0.002907
 0.002907  0.000000  0.997093  0.000000
 0.075581  0.328488  0.095930  0.500000
 0.819767  0.087209  0.002907  0.090116
 0.837209  0.005814  0.008721  0.148256
URL https://jaspar.elixir.no/matrix/UN1290.1

MOTIF MA0205.1 Trl
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 71 E= 0
 0.056338  0.309859  0.126761  0.507042
 0.084507  0.323944  0.154930  0.436620
 0.169014  0.084507  0.422535  0.323944
 0.000000  0.901408  0.042254  0.056338
 0.042254  0.000000  0.197183  0.760563
 0.014085  0.985915  0.000000  0.000000
 0.183099  0.000000  0.028169  0.788732
 0.070423  0.760563  0.098592  0.070423
 0.098592  0.183099  0.154930  0.563380
 0.126761  0.464789  0.140845  0.267606
URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0205.1

MOTIF MA0205.2 Trl
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 6858 E= 0
 0.322251  0.193934  0.391805  0.092009
 0.381744  0.196559  0.287547  0.134150
 0.598863  0.087052  0.277340  0.036745
 0.964275  0.006853  0.006416  0.022456
 0.013269  0.007874  0.952902  0.025955
 0.983231  0.003062  0.006416  0.007291
 0.001458  0.005541  0.989064  0.003937
 0.962817  0.026538  0.006562  0.004083
 0.020560  0.004229  0.967921  0.007291
 0.744386  0.123214  0.072178  0.060222
 0.275299  0.090551  0.554097  0.080052
 0.435112  0.126859  0.317731  0.120297
URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0205.2

MOTIF MA0205.3 Trl
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 6858 E= 0
 0.598863  0.087052  0.277340  0.036745
 0.964275  0.006853  0.006416  0.022456
 0.013269  0.007874  0.952902  0.025955
 0.983231  0.003062  0.006416  0.007291
 0.001458  0.005541  0.989064  0.003937
 0.962817  0.026538  0.006562  0.004083
 0.020560  0.004229  0.967921  0.007291
 0.744386  0.123214  0.072178  0.060222
 0.275299  0.090551  0.554097  0.080052
URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0205.3

MOTIF MA0633.1 Twist2
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1000 E= 0
 0.302000  0.200000  0.298000  0.200000
 0.282000  0.580000  0.069000  0.069000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.217000  0.000000  0.783000
 0.789000  0.000000  0.211000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.050000  0.050000  0.155000  0.745000
 0.181181  0.181181  0.272272  0.365365
URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0633.1

MOTIF MA0633.2 Twist2
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 49629 E= 0
 0.261923  0.282174  0.258820  0.197082
 0.277459  0.293679  0.318886  0.109976
 0.000302  0.996857  0.001632  0.001209
 0.985613  0.006952  0.007435  0.000000
 0.000181  0.000322  0.999073  0.000423
 0.000423  0.999073  0.000322  0.000181
 0.000000  0.007435  0.006891  0.985674
 0.001209  0.001632  0.996857  0.000302
 0.109976  0.318886  0.293679  0.277459
 0.198392  0.258820  0.280864  0.261923
URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0633.2

