MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0413.2 USV1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 997 E= 0 0.133400 0.055165 0.157472 0.653962 0.318637 0.552104 0.101202 0.028056 0.001003 0.969910 0.026078 0.003009 0.000000 0.979940 0.000000 0.020060 0.003006 0.994990 0.001002 0.001002 0.001002 0.982966 0.000000 0.016032 0.000000 0.006012 0.003006 0.990982 0.000000 0.002006 0.871615 0.126379 0.958877 0.000000 0.036108 0.005015 0.851703 0.092184 0.021042 0.035070 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0413.2 MOTIF MA0094.1 Ubx letter-probability matrix: alength= 4 w= 4 nsites= 88 E= 0 0.034091 0.000000 0.000000 0.965909 0.818182 0.045455 0.034091 0.102273 0.897727 0.011364 0.068182 0.022727 0.011364 0.056818 0.045455 0.886364 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0094.1 MOTIF MA0094.2 Ubx letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 20 E= 0 0.150000 0.250000 0.150000 0.450000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.850000 0.000000 0.000000 0.150000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.300000 0.700000 0.700000 0.000000 0.300000 0.000000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0094.2 MOTIF MA0094.3 Ubx letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 20 E= 0 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.850000 0.000000 0.000000 0.150000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.300000 0.700000 0.700000 0.000000 0.300000 0.000000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0094.3 MOTIF MA1925.1 Uncx-b letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1000 E= 0 0.322000 0.178000 0.183000 0.317000 0.327327 0.182182 0.186186 0.304304 0.305000 0.190000 0.190000 0.315000 0.266000 0.198000 0.181000 0.355000 0.284284 0.189189 0.188188 0.338338 0.375000 0.184000 0.196000 0.245000 0.364000 0.176000 0.200000 0.260000 0.104000 0.088000 0.075000 0.733000 0.051000 0.049000 0.025000 0.875000 0.875000 0.030000 0.051000 0.044000 0.905000 0.023000 0.028000 0.044000 0.044000 0.030000 0.027000 0.899000 0.048951 0.053946 0.040959 0.856144 0.419000 0.129000 0.200000 0.252000 0.325000 0.182000 0.233000 0.260000 0.269000 0.212000 0.198000 0.321000 0.241000 0.192000 0.187000 0.380000 0.279720 0.194805 0.186813 0.338661 0.318000 0.177000 0.187000 0.318000 0.283000 0.183000 0.191000 0.343000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1925.1 MOTIF MA1925.2 Uncx-b letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 1000 E= 0 0.104000 0.088000 0.075000 0.733000 0.051000 0.049000 0.025000 0.875000 0.875000 0.030000 0.051000 0.044000 0.905000 0.023000 0.028000 0.044000 0.044000 0.030000 0.027000 0.899000 0.048951 0.053946 0.040959 0.856144 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1925.2 MOTIF MA1926.1 Usf letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1000 E= 0 0.274000 0.246000 0.238000 0.242000 0.258258 0.259259 0.229229 0.253253 0.303696 0.198801 0.230769 0.266733 0.321321 0.163163 0.270270 0.245245 0.397000 0.121000 0.399000 0.083000 0.144000 0.212000 0.110000 0.534000 0.043000 0.878000 0.042000 0.037000 0.980000 0.006000 0.007000 0.007000 0.007992 0.954046 0.007992 0.029970 0.024024 0.009009 0.958959 0.008008 0.008008 0.008008 0.006006 0.977978 0.009990 0.017982 0.963037 0.008991 0.668332 0.072927 0.165834 0.092907 0.080000 0.424000 0.110000 0.386000 0.268731 0.271728 0.159840 0.299700 0.291000 0.234000 0.196000 0.279000 0.281000 0.232000 0.253000 0.234000 0.271271 0.238238 0.244244 0.246246 0.267000 0.243000 0.239000 0.251000 0.268000 0.245000 0.241000 0.246000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1926.1 MOTIF MA2290.1 Usf letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1000 E= 0 0.562500 0.250000 0.187500 0.000000 0.062500 0.625000 0.062500 0.250000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.833333 0.000000 0.111111 0.055556 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.222222 0.000000 0.777778 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.666667 0.000000 0.222222 0.111111 0.000000 0.666667 0.222222 0.111111 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA2290.1 MOTIF MA1926.2 Usf letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1000 E= 0 0.043000 0.878000 0.042000 0.037000 0.980000 0.006000 0.007000 0.007000 0.007992 0.954046 0.007992 0.029970 0.024024 0.009009 0.958959 0.008008 0.008008 0.008008 0.006006 0.977978 0.009990 0.017982 0.963037 0.008991 0.668332 0.072927 0.165834 0.092907 0.080000 0.424000 0.110000 0.386000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1926.2 MOTIF MA0722.1 VAX1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 6156 E= 0 0.072612 0.450780 0.073912 0.402697 0.096614 0.141577 0.014371 0.747439 0.795066 0.130619 0.028606 0.045709 0.940555 0.027395 0.008236 0.023814 0.050778 0.014703 0.036416 0.898102 0.063239 0.039960 0.242873 0.653928 0.742999 0.012306 0.188402 0.056294 0.185954 0.363723 0.177579 0.272745 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0722.1