MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF UN0443.2 Bcl6 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 1000 E= 0 0.239000 0.051000 0.612000 0.098000 0.051000 0.882000 0.020000 0.047000 0.241000 0.099000 0.016000 0.644000 0.092000 0.131000 0.041000 0.736000 0.006000 0.015000 0.009000 0.970000 0.004004 0.971972 0.006006 0.018018 0.014985 0.164835 0.587413 0.232767 0.945055 0.016983 0.015984 0.021978 0.103000 0.008000 0.880000 0.009000 0.060000 0.069000 0.802000 0.069000 0.789000 0.042000 0.091000 0.078000 0.797000 0.048000 0.057000 0.098000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/UN0443.2 MOTIF MA0242.1 Bgb::run letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 29 E= 0 0.413793 0.068966 0.000000 0.517241 0.931034 0.000000 0.034483 0.034483 0.965517 0.000000 0.034483 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.965517 0.034483 0.000000 0.172414 0.034483 0.793103 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.965517 0.000000 0.000000 0.034483 0.689655 0.000000 0.310345 0.000000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0242.1 MOTIF MA0607.1 Bhlha15 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1001 E= 0 0.142857 0.570430 0.285714 0.000999 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.200200 0.799800 0.799800 0.200200 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.001000 0.231000 0.154000 0.614000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0607.1 MOTIF MA1472.2 Bhlha15 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 21916 E= 0 0.239551 0.253377 0.288054 0.219018 0.324010 0.301652 0.247217 0.127122 0.692325 0.150484 0.131548 0.025643 0.012274 0.967147 0.016107 0.004472 0.969383 0.005795 0.007255 0.017567 0.005156 0.015012 0.953824 0.026008 0.026008 0.953824 0.015012 0.005156 0.017567 0.007255 0.005795 0.969383 0.004472 0.016107 0.967147 0.012274 0.025643 0.131548 0.150484 0.692325 0.127122 0.247125 0.301652 0.324101 0.219018 0.288054 0.253285 0.239642 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1472.2 MOTIF MA1472.3 Bhlha15 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 21916 E= 0 0.692325 0.150484 0.131548 0.025643 0.012274 0.967147 0.016107 0.004472 0.969383 0.005795 0.007255 0.017567 0.005156 0.015012 0.953824 0.026008 0.026008 0.953824 0.015012 0.005156 0.017567 0.007255 0.005795 0.969383 0.004472 0.016107 0.967147 0.012274 0.025643 0.131548 0.150484 0.692325 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1472.3 MOTIF MA0464.1 Bhlhe40 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 15804 E= 0 0.102885 0.434574 0.399329 0.063212 0.308087 0.033156 0.199064 0.459694 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.917046 0.000000 0.082954 0.181916 0.070046 0.748038 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.244179 0.754176 0.001645 0.000000 0.419451 0.269236 0.021830 0.289484 0.128322 0.398190 0.232916 0.240572 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0464.1 MOTIF MA2198.1 Blimp-1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 998 E= 0 0.117234 0.560120 0.076152 0.246493 0.752505 0.140281 0.095190 0.012024 0.019038 0.941884 0.025050 0.014028 0.009018 0.047094 0.019038 0.924850 0.032064 0.155311 0.015030 0.797595 0.046092 0.029058 0.041082 0.883768 0.000000 0.890782 0.005010 0.104208 0.593186 0.160321 0.183367 0.063126 0.125251 0.611222 0.102204 0.161323 0.078078 0.217217 0.058058 0.646647 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA2198.1 MOTIF MA1846.1 Brachyury letter-probability matrix: alength= 4 w= 22 nsites= 1000 E= 0 0.268000 0.280000 0.244000 0.208000 0.281281 0.156156 0.317317 0.245245 0.155000 0.544000 0.139000 0.162000 0.450000 0.119000 0.265000 0.166000 0.181181 0.348348 0.231231 0.239239 0.255744 0.224775 0.291708 0.227772 0.224000 0.199000 0.237000 0.340000 0.696000 0.044000 0.146000 0.114000 0.108000 0.104000 0.658000 0.130000 0.052000 0.028000 0.877000 0.043000 0.013000 0.041000 0.027000 0.919000 0.018000 0.007000 0.961000 0.014000 0.053000 0.178000 0.056000 0.713000 0.052947 0.106893 0.710290 0.129870 0.868000 0.023000 0.056000 0.053000 0.423000 0.160000 0.203000 0.214000 0.379000 0.153000 0.187000 0.281000 0.231000 0.154000 0.184000 0.431000 0.215215 0.195195 0.232232 0.357357 0.193806 0.191808 0.246753 0.367632 0.237000 0.251000 0.284000 0.228000 0.237762 0.213786 0.313686 0.234765 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1846.1 MOTIF MA1846.2 Brachyury letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1000 E= 0 0.696000 0.044000 0.146000 0.114000 0.108000 0.104000 0.658000 0.130000 0.052000 0.028000 0.877000 0.043000 0.013000 0.041000 0.027000 0.919000 0.018000 0.007000 0.961000 0.014000 0.053000 0.178000 0.056000 0.713000 0.052947 0.106893 0.710290 0.129870 0.868000 0.023000 0.056000 0.053000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1846.2 MOTIF MA1847.1 Bsx letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1000 E= 0 0.315000 0.201000 0.229000 0.255000 0.328000 0.195000 0.232000 0.245000 0.241000 0.237000 0.251000 0.271000 0.234000 0.234000 0.286000 0.246000 0.251000 0.306000 0.233000 0.210000 0.222222 0.259259 0.367367 0.151151 0.255000 0.227000 0.244000 0.274000 0.020000 0.025000 0.008000 0.947000 0.925000 0.017000 0.025000 0.033000 0.967033 0.010989 0.011988 0.009990 0.036000 0.039000 0.053000 0.872000 0.033000 0.131000 0.116000 0.720000 0.189810 0.024975 0.749251 0.035964 0.218218 0.290290 0.286286 0.205205 0.171171 0.307307 0.211211 0.310310 0.221000 0.253000 0.262000 0.264000 0.276000 0.246000 0.223000 0.255000 0.287000 0.227000 0.224000 0.262000 0.259000 0.235000 0.203000 0.303000 0.258741 0.229770 0.218781 0.292707 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1847.1