MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF UN0486.1 CUX1::HOXA13 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 610 E= 0 0.911475 0.000000 0.009836 0.078689 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.016051 0.892456 0.000000 0.091493 0.087986 0.054146 0.854484 0.003384 0.984071 0.000000 0.000000 0.015929 0.012027 0.000000 0.032646 0.955326 0.035971 0.440647 0.010791 0.512590 0.875899 0.046763 0.026978 0.050360 0.062950 0.440647 0.079137 0.417266 0.052158 0.521583 0.397482 0.028777 0.035656 0.445705 0.063209 0.455429 0.163327 0.557114 0.108216 0.171343 0.523156 0.029160 0.430532 0.017153 0.001701 0.025510 0.027211 0.945578 0.569089 0.267144 0.035824 0.127943 0.822485 0.060651 0.023669 0.093195 0.908497 0.006536 0.032680 0.052288 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/UN0486.1 MOTIF UN0487.1 CUX1::HOXB13 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 3260 E= 0 0.146012 0.517791 0.303374 0.032822 0.057346 0.410248 0.034611 0.497794 0.343917 0.450445 0.026113 0.179525 0.502549 0.012017 0.471959 0.013474 0.000000 0.018813 0.012663 0.968524 0.779104 0.010477 0.050349 0.160070 0.880013 0.034845 0.004274 0.080868 0.894719 0.033757 0.028409 0.043115 0.287901 0.332711 0.054145 0.325243 0.969576 0.000000 0.000000 0.030424 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.006679 0.647495 0.000000 0.345826 0.002600 0.002972 0.994428 0.000000 0.935360 0.012229 0.029700 0.022711 0.052021 0.060968 0.000000 0.887011 0.145740 0.495516 0.073244 0.285501 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/UN0487.1 MOTIF UN0928.1 CUX1::POU2F2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 2940 E= 0 0.788435 0.041156 0.074830 0.095578 0.075510 0.060544 0.067007 0.796939 0.063265 0.625510 0.054082 0.257143 0.229592 0.058503 0.674830 0.037075 0.890136 0.037755 0.027211 0.044898 0.146939 0.016327 0.024490 0.812245 0.019388 0.023469 0.021088 0.936054 0.994898 0.001020 0.002041 0.002041 0.010204 0.010204 0.010884 0.968707 0.006122 0.010884 0.958503 0.024490 0.015986 0.877551 0.013946 0.092517 0.753061 0.003401 0.006122 0.237415 0.882313 0.009524 0.058844 0.049320 0.963605 0.005102 0.012245 0.019048 0.043878 0.026190 0.019048 0.910884 0.101701 0.086054 0.225510 0.586735 0.680272 0.049320 0.098980 0.171429 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/UN0928.1 MOTIF UN0488.1 CUX1::TBX21 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 2053 E= 0 0.184608 0.157818 0.011203 0.646371 0.149743 0.702442 0.128535 0.019280 0.698421 0.031053 0.207895 0.062632 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.792712 0.009558 0.197730 0.000000 0.041252 0.943812 0.001422 0.013514 0.033788 0.862248 0.062378 0.041585 0.061571 0.603680 0.000000 0.334749 0.541854 0.073499 0.250306 0.134341 0.855026 0.018686 0.062500 0.063789 0.029872 0.026316 0.000000 0.943812 0.484307 0.189051 0.136131 0.190511 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/UN0488.1 MOTIF UN0488.2 CUX1::TBX21 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 2053 E= 0 0.184608 0.157818 0.011203 0.646371 0.149743 0.702442 0.128535 0.019280 0.698421 0.031053 0.207895 0.062632 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.792712 0.009558 0.197730 0.000000 0.041252 0.943812 0.001422 0.013514 0.033788 0.862248 0.062378 0.041585 0.061571 0.603680 0.000000 0.334749 0.541854 0.073499 0.250306 0.134341 0.855026 0.018686 0.062500 0.063789 0.029872 0.026316 0.000000 0.943812 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/UN0488.2 MOTIF MA0755.1 CUX2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 62500 E= 0 0.129776 0.073168 0.067952 0.729104 0.527657 0.058672 0.272507 0.141163 0.975698 0.005353 0.011562 0.007387 0.009902 0.038058 0.010026 0.942014 0.001592 0.980548 0.002023 0.015837 0.298161 0.004505 0.688779 0.008555 0.990803 0.001500 0.003544 0.004153 0.008551 0.006003 0.001425 0.984020 0.591936 0.152371 0.098554 0.157139 0.434694 0.209217 0.110950 0.245139 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0755.1 MOTIF MA0755.2 CUX2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 62500 E= 0 0.129776 0.073168 0.067952 0.729104 0.527657 0.058672 0.272507 0.141163 0.975698 0.005353 0.011562 0.007387 0.009902 0.038058 0.010026 0.942014 0.001592 0.980548 0.002023 0.015837 0.298161 0.004505 0.688779 0.008555 0.990803 0.001500 0.003544 0.004153 0.008551 0.006003 0.001425 0.984020 0.591936 0.152371 0.098554 0.157139 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0755.2 MOTIF MA2110.1 Cdx letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1000 E= 0 0.092000 0.027000 0.047000 0.834000 0.089910 0.015984 0.018981 0.875125 0.131000 0.013000 0.028000 0.828000 0.966000 0.006000 0.013000 0.015000 0.037037 0.042042 0.026026 0.894895 0.093000 0.019000 0.230000 0.658000 0.201000 0.020000 0.740000 0.039000 0.085000 0.600000 0.148000 0.167000 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA2110.1 MOTIF MA0102.1 Cebpa letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 18 E= 0 0.166667 0.000000 0.000000 0.833333 0.055556 0.055556 0.222222 0.666667 0.222222 0.055556 0.333333 0.388889 0.111111 0.500000 0.111111 0.277778 0.222222 0.111111 0.555556 0.111111 0.111111 0.833333 0.000000 0.055556 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.333333 0.111111 0.555556 0.277778 0.333333 0.277778 0.111111 0.111111 0.277778 0.166667 0.444444 0.055556 0.333333 0.277778 0.333333 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA0102.1 MOTIF MA1848.1 Cebpg letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1001 E= 0 0.263736 0.243756 0.252747 0.239760 0.252252 0.248248 0.253253 0.246246 0.258000 0.252000 0.259000 0.231000 0.263000 0.254000 0.237000 0.246000 0.273000 0.237000 0.273000 0.217000 0.260000 0.244000 0.264000 0.232000 0.233000 0.208000 0.234000 0.325000 0.805000 0.049000 0.110000 0.036000 0.038000 0.033000 0.028000 0.901000 0.019019 0.020020 0.018018 0.942943 0.097000 0.012000 0.820000 0.071000 0.015000 0.952000 0.011000 0.022000 0.753000 0.062000 0.117000 0.068000 0.296000 0.255000 0.188000 0.261000 0.230230 0.262262 0.218218 0.289289 0.296000 0.237000 0.228000 0.239000 0.250000 0.252000 0.235000 0.263000 0.253000 0.241000 0.230000 0.276000 0.244000 0.244000 0.251000 0.261000 0.241241 0.254254 0.249249 0.255255 URL https://jaspar.elixir.no/matrix/MA1848.1